Lompat ke isi

SYBR Hijau I: Perbedaan antara revisi

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Jelajahi riwayat secara interaktif
Konten dihapus Konten ditambahkan
VisualTeks wiki
25kartika (bicara | kontrib)
467 suntingan
←Membuat halaman berisi ''''SYBR® Green''' merupakan suatu senyawa yang biasa digunakan untuk mewarnai DNA. senyawa ini hanya dapat berikatan dengan DNA utas ganda. Pada larutan normal (tanpa D...'
 
k Bot: Perubahan kosmetika
 
(37 revisi perantara oleh 9 pengguna tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
<!-- Below the chembox. Notes:
'''SYBR® Green''' merupakan suatu senyawa yang biasa digunakan untuk mewarnai DNA. senyawa ini hanya dapat berikatan dengan DNA utas ganda.
* Parameters work only in their own section.
⚫
Pada larutan normal (tanpa DNA) senyawa ini akan berfluorescent dalam jumlah sedikit. akan tetapi jika sejumlah DNA ditambahkan dalam larutan, maka SYBR® Green akan langsung berikatan dengan DNA utas ganda dan langsung meningkatkan kemampuan fluorescentnya hingga 1000 kali. jadi semakin besar konsentrasi DNA dalam larutan, semakin terang pendaran yang dihasilkan.
* When a parameter is not needed, please leave it empty, when a parameter is wrong, just clear its contents.
* When a section is really not needed, delete the whole section.
For more information, see [[template:chembox]]. -->
{{Chembox
| ImageFile = SYBR Green I.png
| ImageSize =
| IUPACName = N',N'-dimethyl-N-[4-[(E)-(3-methyl-1,3-benzothiazol-2-ylidene)methyl]-1-phenylquinolin-1-ium-2-yl]-N-propylpropane-1,3-diamine
| OtherNames =
| Section1 = {{Chembox Identifiers
| PubChem = 10436340
| CASNo = 163795-75-3
| SMILES = }}
| Section2 = {{Chembox Properties
| Formula = C<sub>32</sub>H<sub>37</sub>N<sub>4</sub>S<sup>+<sup>
| MolarMass = 509.73 [[Gram|g]]·[[mol]]<sup>−1</sup>
| Appearance =
| Density =
| MeltingPt =
| BoilingPt =
| SolubleOther = Soluble in [[Dimethylsulfoxide]] }}
| Section3 = {{Chembox Hazards
| MainHazards =
| FlashPt =
| Autoignition = }}
}}<!-- Text starts below-->
'''SYBR® Green''' merupakan suatu [[senyawa]] berfluorescent yang biasa digunakan untuk mewarnai [[DNA]] karena kemampuannya sebagai [[interkalat]] yaitu menyisip di antara basa-[[basa nitrogen]] pada DNA.{{fact}} senyawa ini hanya dapat berfluorescent secara maksimal jika berikatan dengan DNA utas ganda.<ref name=Osborn_2005>Osborn AM,Smith CJ.(2005).''Molecular Microbial Ecology,hlm 156''.Tylor & Francis:New York.</ref>

⚫
Pada [[larutan]] normal (tanpa DNA) senyawa ini akan ber[[fluorescent]] dalam jumlah sedikit.{{fact}} akan tetapi jika sejumlah DNA ditambahkan dalam larutan, maka SYBR® Green akan langsung berikatan dengan DNA utas ganda dan langsung meningkatkan kemampuan fluorescentnya hingga 1000 kali.{{fact}} jadi semakin besar konsentrasi DNA dalam larutan, semakin terang pendaran yang dihasilkan.<ref name=Cheng_2008>Cheng L,Zang DY.(2008).''Molecular Genetic Pathology,hlm 87''.Humana Press:New York.</ref>

== Kelebihan ==
=== Stabil ===
SYBR® Green bersifat stabil yaitu tidak mudah berubah [[konformasi]]nya pada berbegai suhu.{{fact}} Hal tersebut sangat menguntungkan karena beberapa [[reaksi]] misalnya reaksi [[PCR]] dilakukan dalam [[suhu]] yang bervariasi.<ref name=Woodford_2004>Woodford N,Johnson AP.(2004).Genomics,Proteomics,and Clinical Bacteriology:Methods and Review,hlm 196.Humana Press,Inc:New Jersey.</ref>

=== Ikatan yang dibentuk ===
Ikatan yang dibentuk antara [[molekul]] SYBR Green dengan DNA bukan merupakan [[ikatan]] [[kovalen]].{{fact}} Hal tersebut mengakibatkan zat warna ini tidak akan mengganggu kerja enzim [[nuklease]] dan [[polimerase]].<ref name=Overturf_2009>Overturf K.(2009).''Molecular Research in Aquaculture,hlm 47''.Blackwell Publishing:Iowa.</ref>

== Aplikasi ==
=== Real-Time PCR ===
SYBR® Green biasa digunakan dalam [[real-time PCR]] karena sifatnya yg stabil dalam berbagai suhu dan karena sifat fluorescentnya yang hanya muncul jika berikatan dengan DNA utas tunggal.<ref name=Dale_2007>Dale J, Schantz MV.(2007).''From Genes to Genomes:Concepts and Applications of DNA technology,hlm 151''.John Wiley & Sons Ltd:England.</ref>

=== Visualisasi DNA ===
SYBR® Green dapat digunakan untuk mewarnai DNA dalam gel akrilamid pada proses [[elekroforesis]].{{fact}}

== Referensi ==
{{reflist}}

[[Kategori:Senyawa karbon]]

Revisi terkini sejak 6 Desember 2018 21.32

SYBR Hijau I
Nama
Nama IUPAC
N',N'-dimethyl-N-[4-[(E)-(3-methyl-1,3-benzothiazol-2-ylidene)methyl]-1-phenylquinolin-1-ium-2-yl]-N-propylpropane-1,3-diamine
Penanda
3DMet {{{3DMet}}}
Nomor EC
Nomor RTECS {{{value}}}
Sifat
C32H37N4S+
Massa molar 509.73 g·mol−1
Kelarutan Soluble in Dimethylsulfoxide
Kecuali dinyatakan lain, data di atas berlaku pada suhu dan tekanan standar (25 °C [77 °F], 100 kPa).
Referensi

SYBR® Green merupakan suatu senyawa berfluorescent yang biasa digunakan untuk mewarnai DNA karena kemampuannya sebagai interkalat yaitu menyisip di antara basa-basa nitrogen pada DNA.[butuh rujukan] senyawa ini hanya dapat berfluorescent secara maksimal jika berikatan dengan DNA utas ganda.[1]

Pada larutan normal (tanpa DNA) senyawa ini akan berfluorescent dalam jumlah sedikit.[butuh rujukan] akan tetapi jika sejumlah DNA ditambahkan dalam larutan, maka SYBR® Green akan langsung berikatan dengan DNA utas ganda dan langsung meningkatkan kemampuan fluorescentnya hingga 1000 kali.[butuh rujukan] jadi semakin besar konsentrasi DNA dalam larutan, semakin terang pendaran yang dihasilkan.[2]

Kelebihan

[sunting | sunting sumber]

Stabil

[sunting | sunting sumber]

SYBR® Green bersifat stabil yaitu tidak mudah berubah konformasinya pada berbegai suhu.[butuh rujukan] Hal tersebut sangat menguntungkan karena beberapa reaksi misalnya reaksi PCR dilakukan dalam suhu yang bervariasi.[3]

Ikatan yang dibentuk

[sunting | sunting sumber]

Ikatan yang dibentuk antara molekul SYBR Green dengan DNA bukan merupakan ikatan kovalen.[butuh rujukan] Hal tersebut mengakibatkan zat warna ini tidak akan mengganggu kerja enzim nuklease dan polimerase.[4]

Aplikasi

[sunting | sunting sumber]

Real-Time PCR

[sunting | sunting sumber]

SYBR® Green biasa digunakan dalam real-time PCR karena sifatnya yg stabil dalam berbagai suhu dan karena sifat fluorescentnya yang hanya muncul jika berikatan dengan DNA utas tunggal.[5]

Visualisasi DNA

[sunting | sunting sumber]

SYBR® Green dapat digunakan untuk mewarnai DNA dalam gel akrilamid pada proses elekroforesis.[butuh rujukan]

Referensi

[sunting | sunting sumber]
  1. ^ Osborn AM,Smith CJ.(2005).Molecular Microbial Ecology,hlm 156.Tylor & Francis:New York.
  2. ^ Cheng L,Zang DY.(2008).Molecular Genetic Pathology,hlm 87.Humana Press:New York.
  3. ^ Woodford N,Johnson AP.(2004).Genomics,Proteomics,and Clinical Bacteriology:Methods and Review,hlm 196.Humana Press,Inc:New Jersey.
  4. ^ Overturf K.(2009).Molecular Research in Aquaculture,hlm 47.Blackwell Publishing:Iowa.
  5. ^ Dale J, Schantz MV.(2007).From Genes to Genomes:Concepts and Applications of DNA technology,hlm 151.John Wiley & Sons Ltd:England.
Diperoleh dari "https://wiki-indonesia.club/w/index.php?title=SYBR_Hijau_I&oldid=14567898"