Serpin
Serpin (serine protease inhibitor) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikasi | |||||||||
Simbol | Serpin, SERPIN (root symbol of family) | ||||||||
Pfam | PF00079 | ||||||||
InterPro | IPR000215 | ||||||||
PROSITE | PDOC00256 | ||||||||
SCOP | 1hle | ||||||||
SUPERFAMILY | 1hle | ||||||||
CDD | cd00172 | ||||||||
|
Serpin atau Serine Protease Inhibitor adalah sebuah kelompok besar protein yang bekerja sebagai penghambat protease dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak tersebar pada makhluk hidup. Gen yang menyerupai serpin telah ditemukan pada binatang, tumbuhan, virus pox dan bakteri. Serpin bekerja dengan cara mengubah bentuk untuk menghambat enzim target.[1]
Struktur
Serpin terdiri dari 350-400 asam amino dan memiliki berat molekul 40-50 kDa. Penyusunnya adalah 3 lembaran beta (A, B, C) dan 8-9 heliks alfa (hA-hI).[2]
Sebagai penghambat protease, serpin memiliki struktur lingkaran yang berguna untuk berhubungan dengan celah aktif protease. Berbeda dengan penghambat protease serin lainnya yang memiliki lingkaran pusat reaktif (LPR) yang pendek dan kaku, serpin memiliki LPR yang panjang dan lentur.[3]
Pembagian
Serpin dibagi dalam beberapa clade yaitu:[4]
- Clade A (serupa Antitripsin)
- Clade B (serupa Ovalbumin)
- Clade C (Antitrombin)
- Clade D (Heparin Kofaktor II)
- Clade E (PAI-1/GDN)
- Clade F (PEDF)
- Clade G (Penghambat C1)
- Clade H (Protein peredam panas 47)
- Clade I (Neuroserpin)