Duplodnaviria

Duplodnaviria ;
	;
Taksonomi
Dunia	Duplodnaviria ;
Tata nama
Sinonim takson	HK97-like group; HK97 major capsid protein supermodule;
Subtakson
	Lihat teks

Duplodnaviria adalah dunia virus yang mencakup semua virus DNA untai ganda yang menyandikan protein kapsid utama lipatan-HK97 (HK97-MCP). Protein ini merupakan komponen utama kapsid virus yang menyimpan asam deoksiribonukleat (DNA) virus. Virus dalam takson ini juga memiliki sejumlah karakteristik lain, seperti kapsid berbentuk ikosahedral, bukaan kapsid virus yang disebut portal, enzim protease yang mengosongkan bagian dalam kapsid sebelum pengemasan DNA, dan enzim terminase yang mengemas DNA virus masuk ke kapsid.

Duplodnaviria ditetapkan pada tahun 2019 berdasarkan kesamaan karakteristik virus dalam takson ini. Ada dua kelompok virus dalam Duplodnaviria: bakteriofag berekor dari ordo Caudovirales yang menginfeksi prokariota dan virus herpes dari ordo Herpesvirales yang menginfeksi hewan. Bakteriofag berekor sangat beragam dan ada di mana-mana di seluruh dunia, dan mereka mungkin merupakan garis keturunan virus tertua. Virus herpes memiliki nenek moyang yang sama dengan bakteriofag berekor atau merupakan kelompok yang memisahkan diri dari dalam Caudovirales.

Bakteriofag berekor berperan penting dalam ekologi laut dengan mendaur ulang nutrisi dalam bahan organik dari inangnya dan dijadikan fokus pada banyak penelitian, sementara virus herpes dikaitkan dengan berbagai penyakit pada hewan, termasuk manusia. Fitur umum di antara virus Duplodnaviria adalah banyak dari mereka yang dapat bertahan di inangnya untuk jangka waktu yang lama tanpa bereplikasi tetapi masih dapat muncul kembali di masa mendatang. Contoh dari hal ini termasuk virus herpes simpleks yang menyebabkan infeksi berulang dan virus varicella zoster yang awalnya menyebabkan cacar air di awal kehidupan lalu herpes zoster di kemudian hari.

Etimologi

Nama Duplodnaviria adalah portmanteau dari duplo, kata bahasa Latin untuk ganda, serta dna, dari asam deoksiribonukleat (DNA), yang merujuk bahwa semua anggota takson ini memiliki genom DNA untai ganda, dan -viria, yang merupakan sufiks yang digunakan untuk dunia virus. Duplodnaviria bersifat monotipik, hanya memiliki satu kerajaan di bawahnya, yaitu Heunggongvirae, sehingga baik takson dunia maupun kerajaan ini memiliki definisi yang sama. Heunggongvirae mengambil bagian pertama namanya dari bahasa Kanton 香港 [Hēunggóng], yang memiliki arti dan kira-kira dilafalkan dengan "Hong Kong", yang merujuk pada virus Escherichia HK97, anggota pendiri virus lipatan MCP HK97 (Hong Kong 97), dan sufiks -virae, yang merupakan sufiks yang digunakan untuk kerajaan virus.^[2]

Klasifikasi

Duplodnaviria hanya memiliki satu kerajaan, dan kerajaan ini dibagi lagi menjadi dua filum yang monotipik hingga turun ke peringkat ordo. Taksonomi ini dapat divisualisasikan sebagai berikut:^[3]

Dunia: Duplodnaviria

Kerajaan: Heunggongvirae

Filum: Peploviricota

Kelas: Herviviricetes

Ordo: Herpesvirales – kelompok virus herpes, yang hanya menginfeksi hewan (eukariota)

Filum: Uroviricota

Kelas: Caudoviricetes

Ordo: Caudovirales – kelompok bakteriofag berekor, yang hanya menginfeksi arkea dan bakteri (prokariota)

Karena semua virus dalam dunia Duplodnaviria merupakan virus DNA beruntai ganda (dsDNA), kelompok ini termasuk dalam Grup I: virus dsDNA menurut klasifikasi Baltimore, sistem klasifikasi berdasarkan cara virus menghasilkan RNA duta (mRNA). Sistem klasifikasi Baltimore sering digunakan bersama dengan standar taksonomi virus, yang didasarkan pada sejarah evolusi.^[2] Dunia adalah tingkat taksonomi tertinggi yang digunakan untuk virus dan Duplodnaviria adalah salah satu dari empat dunia, tiga lainnya adalah Monodnaviria, Riboviria, dan Varidnaviria.^[3]

Referensi

^ Suhanovsky MM, Teschke CM (May 2015). "Nature's favorite building block: Deciphering folding and capsid assembly of proteins with the HK97-fold". Virology. 479-480: 479–480. doi:10.1016/j.virol.2015.02.055. PMC 4424165 . PMID 25864106.
^ ^a ^b ^c Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (18 October 2019). "Create a megataxonomic framework, filling all principal/primary taxonomic ranks, for dsDNA viruses encoding HK97-type major capsid proteins" (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 19 May 2020.
^ ^a ^b "Virus Taxonomy: 2019 Release". talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Diakses tanggal 25 April 2020.

[suhanovsky-1] Suhanovsky MM, Teschke CM (May 2015). "Nature's favorite building block: Deciphering folding and capsid assembly of proteins with the HK97-fold". Virology. 479-480: 479–480. doi:10.1016/j.virol.2015.02.055. PMC 4424165 . PMID 25864106.

[proposal-2] Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (18 October 2019). "Create a megataxonomic framework, filling all principal/primary taxonomic ranks, for dsDNA viruses encoding HK97-type major capsid proteins" (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 19 May 2020.

[ictv-3] "Virus Taxonomy: 2019 Release". talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Diakses tanggal 25 April 2020.

[1]

[2]

[3]