SYBR Hijau I: Perbedaan antara revisi

SYBR Hijau I
Nama
	Nama IUPAC N',N'-dimethyl-N-[4-[(E)-(3-methyl-1,3-benzothiazol-2-ylidene)methyl]-1-phenylquinolin-1-ium-2-yl]-N-propylpropane-1,3-diamine
Penanda
Nomor CAS	163795-75-3;
3DMet	{{{3DMet}}}
Nomor EC
PubChem CID	10436340;
Nomor RTECS	{{{value}}}
CompTox Dashboard (EPA)	DTXSID60936871 ;
Sifat
Rumus kimia	C32H37N4S+
Massa molar	509.73 g·mol−1
Kelarutan	Soluble in Dimethylsulfoxide
	Kecuali dinyatakan lain, data di atas berlaku pada suhu dan tekanan standar (25 °C [77 °F], 100 kPa).
	Referensi

Jelajahi riwayat secara interaktif

← Revisi sebelumnya

Konten dihapus Konten ditambahkan

VisualTeks wiki

Sebaris

Revisi terkini sejak 6 Desember 2018 21.32

SYBR® Green merupakan suatu senyawa berfluorescent yang biasa digunakan untuk mewarnai DNA karena kemampuannya sebagai interkalat yaitu menyisip di antara basa-basa nitrogen pada DNA.^{[butuh rujukan]} senyawa ini hanya dapat berfluorescent secara maksimal jika berikatan dengan DNA utas ganda.^[1]

Pada larutan normal (tanpa DNA) senyawa ini akan berfluorescent dalam jumlah sedikit.^{[butuh rujukan]} akan tetapi jika sejumlah DNA ditambahkan dalam larutan, maka SYBR® Green akan langsung berikatan dengan DNA utas ganda dan langsung meningkatkan kemampuan fluorescentnya hingga 1000 kali.^{[butuh rujukan]} jadi semakin besar konsentrasi DNA dalam larutan, semakin terang pendaran yang dihasilkan.^[2]

Kelebihan

Stabil

SYBR® Green bersifat stabil yaitu tidak mudah berubah konformasinya pada berbegai suhu.^{[butuh rujukan]} Hal tersebut sangat menguntungkan karena beberapa reaksi misalnya reaksi PCR dilakukan dalam suhu yang bervariasi.^[3]

Ikatan yang dibentuk

Ikatan yang dibentuk antara molekul SYBR Green dengan DNA bukan merupakan ikatan kovalen.^{[butuh rujukan]} Hal tersebut mengakibatkan zat warna ini tidak akan mengganggu kerja enzim nuklease dan polimerase.^[4]

Aplikasi

Real-Time PCR

SYBR® Green biasa digunakan dalam real-time PCR karena sifatnya yg stabil dalam berbagai suhu dan karena sifat fluorescentnya yang hanya muncul jika berikatan dengan DNA utas tunggal.^[5]

Visualisasi DNA

SYBR® Green dapat digunakan untuk mewarnai DNA dalam gel akrilamid pada proses elekroforesis.^{[butuh rujukan]}

Referensi

^ Osborn AM,Smith CJ.(2005).Molecular Microbial Ecology,hlm 156.Tylor & Francis:New York.
^ Cheng L,Zang DY.(2008).Molecular Genetic Pathology,hlm 87.Humana Press:New York.
^ Woodford N,Johnson AP.(2004).Genomics,Proteomics,and Clinical Bacteriology:Methods and Review,hlm 196.Humana Press,Inc:New Jersey.
^ Overturf K.(2009).Molecular Research in Aquaculture,hlm 47.Blackwell Publishing:Iowa.
^ Dale J, Schantz MV.(2007).From Genes to Genomes:Concepts and Applications of DNA technology,hlm 151.John Wiley & Sons Ltd:England.

[Osborn_2005-1] Osborn AM,Smith CJ.(2005).Molecular Microbial Ecology,hlm 156.Tylor & Francis:New York.

[Cheng_2008-2] Cheng L,Zang DY.(2008).Molecular Genetic Pathology,hlm 87.Humana Press:New York.

[Woodford_2004-3] Woodford N,Johnson AP.(2004).Genomics,Proteomics,and Clinical Bacteriology:Methods and Review,hlm 196.Humana Press,Inc:New Jersey.

[Overturf_2009-4] Overturf K.(2009).Molecular Research in Aquaculture,hlm 47.Blackwell Publishing:Iowa.

[Dale_2007-5] Dale J, Schantz MV.(2007).From Genes to Genomes:Concepts and Applications of DNA technology,hlm 151.John Wiley & Sons Ltd:England.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

@@ Baris 26: / Baris 26: @@
 | Autoignition = }}
 }}<!-- Text starts below-->
-'''SYBR® Green''' merupakan suatu [[senyawa]] yang biasa digunakan untuk mewarnai [[DNA]] karena kemampuannya sebagai [[interkalat]] yaitu menyisip diantara basa-[[basa nitrogen]] pada DNA. senyawa ini hanya dapat berfluorescent secara maksimal jika berikatan dengan DNA utas ganda. <ref name=Osborn_2005>Osborn AM,Smith CJ.(2005).''Molecular Microbial Ecology,hlm 156''.Tylor & Francis:New York.</ref>
+'''SYBR® Green''' merupakan suatu [[senyawa]] berfluorescent yang biasa digunakan untuk mewarnai [[DNA]] karena kemampuannya sebagai [[interkalat]] yaitu menyisip di antara basa-[[basa nitrogen]] pada DNA.{{fact}} senyawa ini hanya dapat berfluorescent secara maksimal jika berikatan dengan DNA utas ganda.<ref name=Osborn_2005>Osborn AM,Smith CJ.(2005).''Molecular Microbial Ecology,hlm 156''.Tylor & Francis:New York.</ref>
+Pada [[larutan]] normal (tanpa DNA) senyawa ini akan ber[[fluorescent]] dalam jumlah sedikit.{{fact}} akan tetapi jika sejumlah DNA ditambahkan dalam larutan, maka SYBR® Green akan langsung berikatan dengan DNA utas ganda dan langsung meningkatkan kemampuan fluorescentnya hingga 1000 kali.{{fact}} jadi semakin besar konsentrasi DNA dalam larutan, semakin terang pendaran yang dihasilkan.<ref name=Cheng_2008>Cheng L,Zang DY.(2008).''Molecular Genetic Pathology,hlm 87''.Humana Press:New York.</ref>
+== Kelebihan ==
-Pada [[larutan]] normal (tanpa DNA) senyawa ini akan ber[[fluorescent]] dalam jumlah sedikit. akan tetapi jika sejumlah DNA ditambahkan dalam larutan, maka SYBR® Green akan langsung berikatan dengan DNA utas ganda dan langsung meningkatkan kemampuan fluorescentnya hingga 1000 kali. jadi semakin besar konsentrasi DNA dalam larutan, semakin terang pendaran yang dihasilkan.<ref name=Cheng_2008>Cheng L,Zang DY.(2008).''Molecular Genetic Pathology,hlm 87''.Humana Press:New York.</ref>
+=== Stabil ===
+SYBR® Green bersifat stabil yaitu tidak mudah berubah [[konformasi]]nya pada berbegai suhu.{{fact}} Hal tersebut sangat menguntungkan karena beberapa [[reaksi]] misalnya reaksi [[PCR]] dilakukan dalam [[suhu]] yang bervariasi.<ref name=Woodford_2004>Woodford N,Johnson AP.(2004).Genomics,Proteomics,and Clinical Bacteriology:Methods and Review,hlm 196.Humana Press,Inc:New Jersey.</ref>
+=== Ikatan yang dibentuk ===
-==Kelebihan==
+Ikatan yang dibentuk antara [[molekul]] SYBR Green dengan DNA bukan merupakan [[ikatan]] [[kovalen]].{{fact}} Hal tersebut mengakibatkan zat warna ini tidak akan mengganggu kerja enzim [[nuklease]] dan [[polimerase]].<ref name=Overturf_2009>Overturf K.(2009).''Molecular Research in Aquaculture,hlm 47''.Blackwell Publishing:Iowa.</ref>
-===Stabil dalam beberapa temperatur===
-Hal tersebut sangat menguntungkan karena beberapa [[reaksi]] misalnya reaksi [[PCR]] dilakukan dalam [[suhu]] yang bervariasi.
-===Ikatan yang dibentuk===
-Ikatan yang dibentuk antara [[molekul]] SYBR Green dengan DNA bukan merupakan [[ikatan]] [[kovalen]]. Hal tersebut mengakibatkan zat warna ini tidak akan mengganggu kerja enzim [[nuklease]] dan [[polimerase]].
-==Aplikasi==
-===Real-Time PCR===
-SYBR Green biasa digunakan dalam [[real-time PCR]]  karena sifatnya yg stabil dalam berbagai suhu dan karena sifat fluorescentnya yang hanya muncul jika berikatan dengan DNA utas tunggal.
+== Aplikasi ==
+=== Real-Time PCR ===
+SYBR® Green biasa digunakan dalam [[real-time PCR]] karena sifatnya yg stabil dalam berbagai suhu dan karena sifat fluorescentnya yang hanya muncul jika berikatan dengan DNA utas tunggal.<ref name=Dale_2007>Dale J, Schantz MV.(2007).''From Genes to Genomes:Concepts and Applications of DNA technology,hlm 151''.John Wiley & Sons Ltd:England.</ref>
+=== Visualisasi DNA ===
+SYBR® Green dapat digunakan untuk mewarnai DNA dalam gel akrilamid pada proses [[elekroforesis]].{{fact}}
 == Referensi ==
 {{reflist}}
+[[Kategori:Senyawa karbon]]