Lompat ke isi

Ralstonia eutropha: Perbedaan antara revisi

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Jelajahi riwayat secara interaktif
← Revisi sebelumnya
Konten dihapus Konten ditambahkan
VisualTeks wiki
BP62Stevanus (bicara | kontrib)
1.213 suntingan
Tidak ada ringkasan suntingan
Tag: BP2014
k →Bioremediasi: clean up
 
(46 revisi perantara oleh 5 pengguna tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
{{Taxobox
{{inuseBP|BP62Stevanus|1 April 2014|1 April 2014}}
| color = lightgrey
| image= Cupriavidus necator.jpg
| image_caption =
| regnum = [[Bacteria]]
| phylum = [[Proteobacteria]]
| ordo = [[Burkholderiales]]
| familia = [[Burkholderiaceae]]
| genus = ''[[Cupriavidus]]''
| species = '''''C. necator''''', (dahulu) ''R. eutropha''
| binomial = ''Cupriavidus necator'', (dahulu) ''Ralstonia eutropha''
| binomial_authority = Makkar and Casida, 1987
}}
⚫
'''''Ralstonia eutropha''''' (disingkat '''''R. eutropha'''''), yang kini dikenal sebagai '''''Cupriavidus necator''''', adalah sebuah [[bakteri]] [[Gram negatif]] yang tergolong dalam kelas ''[[beta-proteobacteria]]''.<ref name="B"/> Bakteri ini merupakan [[organisme model]] untuk mempelajari metabolisme [[polihidroksi alkanoat]].<ref name="F"/>


⚫
== Deskripsi dan Taksonomi ==
⚫
'''''Ralstonia eutropha''''' (disingkat '''''R. eutropha'''''), yang kini dikenal sebagai '''''Cupriavidus necator''''', adalah sebuah [[bakteri]] [[Gram negatif]] yang tergolong dalam kelas [[beta-proteobakteria]]. Bakteri ini merupakan [[organisme model]] untuk mempelajari metabolisme [[polihidroksi alkanoat]].
⚫
''R. eutropha'' termasuk dalam kelas betaproteobacteria dan telah beberapa kali mengalami pergantian nama.<ref name="A"/> Pada awalnya ''R. eutropha'' disebut sebagai ''[[Alcaligenes eutrophus]]'', kini bakteri tersebut ditetapkan dengan nama ''Cupriavidus necator''.<ref name="A">{{en}} {{cite book
⚫
|last = Ramos JL, Levesque LC.
⚫
|first =
⚫
|authorlink =
⚫
|title = Pseudomonas: Volume 4: Molecular Biology of Emerging Issues
⚫
|publisher = Springer
⚫
|year = 2006
⚫
|id = ISBN 0-306-48378-5, 9780306483783}}
⚫
</ref>


⚫
''R. eutropha'' merupakan bakteri Gram negatif berbentuk batang dengan [[flagella]] yang berbentuk [[peritrikus]].<ref name="B"/> ''R. eutropha'' mempunyai aktivitas [[katalase]] dan [[oksidase]].<ref name="B"/> Bakteri ini tahan terhadap berbagai [[ion]] [[logam]] dan mampu menggunakan beberapa [[asam amino]] sebagai sumber [[karbon]] dan [[nitrogen]] tunggal. Konten basa [[Guanin]] dan [[Sitosin]] pada bakteri dalam genus ''Cupriavidus'' adallah sekitar 63 sampai 69 [[mol]]%.<ref name="B"/> ''R. eutropha'' adalah jenis bakteri yang umum ditemukan di tanah.<ref name="B">{{en}} {{cite journal
⚫
==Deskripsi dan Taksonomi==
⚫
''R. eutropha'' termasuk dalam kelas betaproteobacteria dan telah beberapa kali mengalami pergantian nama. Pada awalnya ''R. eutropha'' disebut sebagai ''Alcaligenes eutrophus'', kini bakteri tersebut ditetapkan dengan nama ''Cupriavidus necator''<ref name="A">{{en}}{{cite book
⚫
| last = Ramos JL, Levesque LC.
⚫
| first =
⚫
| authorlink =
⚫
| title = Pseudomonas: Volume 4: Molecular Biology of Emerging Issues
⚫
| publisher = Springer
⚫
| year = 2006
⚫
| id = ISBN 0306483785, 9780306483783}}
⚫
</ref>.

⚫
''R. eutropha'' merupakan bakteri Gram negatif berbentuk batang dengan [[flagella]] yang berbentuk [[peritrikus]]. ''R. eutropha'' mempunyai aktivitas [[katalase]] dan [[oksidase]]. Bakteri ini tahan terhadap berbagai [[ion]] [[logam]] dan mampu menggunakan beberapa [[asam amino]] sebagai sumber [[karbon]] dan [[nitrogen]] tunggal. Konten basa [[Guanin]] dan [[Sitosin]] pada bakteri dalam genus ''Cupriavidus'' adallah sekitar 63 sampai 69 [[mol]]%. ''R. eutropha'' adalah jenis bakteri yang umum ditemukan di tanah <ref name="B">{{en}}{{cite journal
| author = Vandamme P, Coenye T.
| author = Vandamme P, Coenye T.
| year = 2004
| year = 2004
Baris 29: Baris 40:
| accessdate = 6 April 2014
| accessdate = 6 April 2014
}}
}}
</ref>.
</ref>


==Kemampuan Metabolisme==
== Kemampuan Metabolisme ==
''R. eutropha'' adalah termasuk bakteri [[litoautotrof]] yang mampu meng[[oksidasi]] gas [[hidrogen]]<ref name="C">{{en}}{{cite journal
''R. eutropha'' adalah termasuk bakteri [[litoautotrof]] yang mampu meng[[oksidasi]] gas [[hidrogen]].<ref name="C">{{en}} {{cite journal
| author = Pohlmann A, ''et al''.
| author = Pohlmann A, ''et al''.
| year = 2006
| year = 2006
Baris 47: Baris 58:
| accessdate = 6 April 2014
| accessdate = 6 April 2014
}}
}}
</ref>. Bakteri ini dapat hidup sebagai [[autotrof]] maupun [[heterotrof]]<ref name="C"/>. Oleh bakteri ini, baik gas hidrogen maupun [[molekul organik]] dapat digunakan sebagai sumber [[energi]]<ref name="C"/>. Sebagai autotrof, bakteri ini dapat mengikat [[karbon dioksida]] melalui [[jalur pentosa-fosfat]], dan sebagai heterotrof, molekul organik dapat dilebur melalui [[siklus Krebs]]<ref name="D">{{en}}{{cite journal
</ref> Bakteri ini dapat hidup sebagai [[autotrof]] maupun [[heterotrof]].<ref name="C"/> Oleh bakteri ini, baik gas hidrogen maupun [[molekul organik]] dapat digunakan sebagai sumber [[energi]].<ref name="C"/> Sebagai autotrof, bakteri ini dapat mengikat [[karbon dioksida]] melalui [[jalur pentosa-fosfat]], dan sebagai heterotrof, molekul organik dapat dilebur melalui [[siklus Krebs]].<ref name="D">{{en}} {{cite journal
| author = Cramm R
| author = Cramm R
| year = 2009
| year = 2009
Baris 62: Baris 73:
| accessdate = 6 April 2014
| accessdate = 6 April 2014
}}
}}
</ref>. Terlebih lagi, ''R. eutropha'' memiliki kemampuan untuk memecah senyawa [[aromatik]], hal ini memberikan potensi kepada ''R. eutropha'' dalam aplikasi [[bioremediasi]]<ref name="E">{{en}}{{cite journal
</ref> Terlebih lagi, ''R. eutropha'' memiliki kemampuan untuk memecah senyawa [[aromatik]], hal ini memberikan potensi kepada ''R. eutropha'' dalam aplikasi [[bioremediasi]].<ref name="E">{{en}} {{cite journal
| author = Lykidis A, ''et al''.
| author = Lykidis A, ''et al''.
| year = 2010
| year = 2010
Baris 77: Baris 88:
| accessdate = 6 April 2014
| accessdate = 6 April 2014
}}
}}
</ref>.
</ref>
Terlebih lagi, untuk mempelajari metabolisme ''R. eutropha'' secara mendalam, [[genom]] ''R. eutropha'' [[galur]] H16 telah diurutkan (di-''[[Sequence]]'') secara menyeluruh<ref name="C"/>. Ukuran genom bakteri tersebut adalah sebesar 7.4 juta pasang basa<ref name="C"/>. Genom terdiri dari dua [[kromosom]] dan satu [[megaplasmid]]<ref name="C"/>.
Terlebih lagi, untuk mempelajari metabolisme ''R. eutropha'' secara mendalam, [[genom]] ''R. eutropha'' [[galur]] H16 telah diurutkan (di-''[[Sequence]]'') secara menyeluruh.<ref name="C"/> Ukuran genom bakteri tersebut adalah sebesar 7.4 juta pasang basa.<ref name="C"/> Genom terdiri dari dua [[kromosom]] dan satu [[megaplasmid]].<ref name="C"/>


== Aplikasi ==
=== Produksi PHA ===
''R. eutropha'' diketahui mampu mengakumulasi polihidroksi alkanoat (PHA), senyawa [[hidrokarbon]] yang dapat dimanfaatkan sebagai [[bioplasik]].{{fact}} PHA dikumpulkan oleh ''R. eutropha'' di dalam sel ketika sumber [[karbon]] berlebih sementara sumber [[nitrogen]] atau [[fosfat]] terbatas.<ref name="F">{{en}} Brigham CJ, Zhila N, Shishatskaya E, Volova TG, Sinskey AJ. 2012. Chapter 17: Manipulation of Ralstonia eutropha Carbon Storage Pathways to Produce Useful Bio-Based Products. Di Dalam: Wang X, Chen J Quinn PJ. 2012. ''Reprogramming Microbial Metabolic Pathways''. Dordrecht: Springer.</ref> Bakteri ini mampu menghasilkan PHA dengan produktivitas yang mencapai 80% dari bobot sel keringnya.<ref name="F"/> Bakteri ini digunakan sebagai organisme model untuk mempelajari biosintesis PHA karena bakteri tersebut mudah dimanipulasi secara [[genetika]].<ref name="F"/>


Bakteri ''R. eutropha'' terbilang relevan dalam industri PHA dan [[bioproduk]] lainnya karena memiliki sifat-sifat berikut:
⚫
==Referensi==
* Dapat di[[rekayasa genetika]]. Hal ini mempermudah mencari galur unggul produksi bioproduk<ref name="F"/>
* Mampu mengggunakan berbagai sumber karbon dalam jangkauan yang luas. ''R. eutropha'' mampu menggunakan substrat karbon yang relatif murah untuk produksi bioproduk, sehingga ongkos produksi dapat ditekan<ref name="F"/>
* Memiliki metabolisme penyimpanan karbon yang kuat, dapat mengakumulasi PHA dalam kemurniann dan produktivitas yang tinggi di dalam sel<ref name="F"/>
* Bersifat autorof, sehingga dapat mengikat karbon dioksida untuk produksi berbagai bioproduk<ref name="F"/>
* Tidak [[patogen]], sehingga meningkatkan keamanan pekerja<ref name="F"/>
* Relatif tahan terhadap beberapa materi beracun, termasuk [[karbon monoksida]]<ref name="F"/>

=== Bioremediasi ===
Selain untuk memproduksi PHA, ''R.eutropha'' mempunyai aplikasi bioteknologi yang luas.<ref name="G"/><ref name="I"/> Bakteri ini dikenal mampu men[[degradasi]] berbagai senyawa aromatik, sehingga aplikasinya dalam bidang bioremediasi dapat dipertimbangkan.<ref name="G">{{en}} Park JM, Kim TY, Lee SY. 2011. [http://www.biomedcentral.com/1752-0509/5/101 Genome-scale reconstruction and in silico analysis of Ralstonia eutropha H16 for polyhydroxyalkanoate synthesis, lithoautothrophic growth, and 2-methyl citric acid production]. BMC System Biol 5: DOI: 101-113.10.1186/1752-0509-5-101</ref> Selain senyawa aromatik, ''R. eutropha'' juga pernah dilaporkan mampu mendegradasi senyawa [[polutan]] lain seperti [[formaldehida]] dan [[etanatiol]].<ref name="I">{{en}}Sedighi M, Vahabzadeh F, Morteza F, Naderifar A. 2013. Ethanatiol degradation by ''Ralstonia eutropha''. ''Biotech Bioprocess Eng'' 18: 827-833.</ref><ref name="H">{{en}}Habibi A, Vahabzadeh F. 2012. Degradation of formaldehide in packed-bed immobilized ''Ralstonia eutropha''. ''Biotechnol Bioprocess Eng'' 18: 455-464.doi:10.1007/s12257-012-0200-5</ref>

=== Produksi Bioproduk Lainnya ===
''R.eutropha'' juga dikenal secara alami mampu memproduksi enzim yang mempunyai aplikasi industri seperti [[esterase]] dan [[lipase]].<ref name="J">{{en}}Song S, Hein S, Steinbuchel A. 2000. Cloning, nucleotide sequence and primary biochemical characterization of esterase EstA from Ralstonia eutropha CH34. ''Biotechnol let'' 22: 444-449.</ref><ref name="K">{{en}} Lu J, Bringham CJ, Rha C, Sinskey AJ. 2013 Characterization of extracellular lipase and its chaperone from Ralstonia eutropha H16. Appl Microbiol Biotechnol 97: 2443-2454.doi:10.1007/s00253-012-4115-z</ref> Lebih jauh lagi, rekayasa genetika pada bakteri ini dapat dilakukan untuk menghasilkan berbagai produk yang memiliki nilai tambah.<ref name="K"/> ''R.eutropha'' telah berhasil direkayasa untuk produksi [[isobutanol]].<ref name="K"/> ''R.eutropha'' juga telah direkayasa hingga mampu memproduksi produksi [[vanilin]] yang berperan dalam memperkaya rasa pada produk makanan.<ref name="F"/> [[Rekayasa genetika]] ''R.eutropha'' untuk produksi [[asam metilsitrat]] untuk industri [[farmasi]] juga pernah dilaporkan.<ref name="L">{{en}} Ewerwing C, Heuser F, Benolken JK, Bramer CO, Steinbuchel A. 2006. Metabolic engineering of strains of ''Ralstonia eutropha'' and ''Pseudomonas putida'' for biotechnological production of 2-methylcitric acid. ''Metab Eng'' 8: 587-602.</ref>

⚫
== Referensi ==
<references/>
<references/>

== Pranala luar ==
* [http://www.researchgate.net/...Ralstonia_eutropha.../79e4150869c541ff42.pdf Artikel komprehensif mengenai ''R. eutropha'']
{{Taxonbar|from=Q12740362}}

[[Kategori:Bakteri]]

Revisi terkini sejak 2 Januari 2023 02.47

Ralstonia eutropha
Klasifikasi ilmiah
Kerajaan:
Bacteria
Filum:
Proteobacteria
Ordo:
Burkholderiales
Famili:
Burkholderiaceae
Genus:
Cupriavidus
Spesies:
C. necator, (dahulu) R. eutropha
Nama binomial
Cupriavidus necator, (dahulu) Ralstonia eutropha
Makkar and Casida, 1987

Ralstonia eutropha (disingkat R. eutropha), yang kini dikenal sebagai Cupriavidus necator, adalah sebuah bakteri Gram negatif yang tergolong dalam kelas beta-proteobacteria.[1] Bakteri ini merupakan organisme model untuk mempelajari metabolisme polihidroksi alkanoat.[2]

Deskripsi dan Taksonomi

[sunting | sunting sumber]

R. eutropha termasuk dalam kelas betaproteobacteria dan telah beberapa kali mengalami pergantian nama.[3] Pada awalnya R. eutropha disebut sebagai Alcaligenes eutrophus, kini bakteri tersebut ditetapkan dengan nama Cupriavidus necator.[3]

R. eutropha merupakan bakteri Gram negatif berbentuk batang dengan flagella yang berbentuk peritrikus.[1] R. eutropha mempunyai aktivitas katalase dan oksidase.[1] Bakteri ini tahan terhadap berbagai ion logam dan mampu menggunakan beberapa asam amino sebagai sumber karbon dan nitrogen tunggal. Konten basa Guanin dan Sitosin pada bakteri dalam genus Cupriavidus adallah sekitar 63 sampai 69 mol%.[1] R. eutropha adalah jenis bakteri yang umum ditemukan di tanah.[1]

Kemampuan Metabolisme

[sunting | sunting sumber]

R. eutropha adalah termasuk bakteri litoautotrof yang mampu mengoksidasi gas hidrogen.[4] Bakteri ini dapat hidup sebagai autotrof maupun heterotrof.[4] Oleh bakteri ini, baik gas hidrogen maupun molekul organik dapat digunakan sebagai sumber energi.[4] Sebagai autotrof, bakteri ini dapat mengikat karbon dioksida melalui jalur pentosa-fosfat, dan sebagai heterotrof, molekul organik dapat dilebur melalui siklus Krebs.[5] Terlebih lagi, R. eutropha memiliki kemampuan untuk memecah senyawa aromatik, hal ini memberikan potensi kepada R. eutropha dalam aplikasi bioremediasi.[6] Terlebih lagi, untuk mempelajari metabolisme R. eutropha secara mendalam, genom R. eutropha galur H16 telah diurutkan (di-Sequence) secara menyeluruh.[4] Ukuran genom bakteri tersebut adalah sebesar 7.4 juta pasang basa.[4] Genom terdiri dari dua kromosom dan satu megaplasmid.[4]

Aplikasi

[sunting | sunting sumber]

Produksi PHA

[sunting | sunting sumber]

R. eutropha diketahui mampu mengakumulasi polihidroksi alkanoat (PHA), senyawa hidrokarbon yang dapat dimanfaatkan sebagai bioplasik.[butuh rujukan] PHA dikumpulkan oleh R. eutropha di dalam sel ketika sumber karbon berlebih sementara sumber nitrogen atau fosfat terbatas.[2] Bakteri ini mampu menghasilkan PHA dengan produktivitas yang mencapai 80% dari bobot sel keringnya.[2] Bakteri ini digunakan sebagai organisme model untuk mempelajari biosintesis PHA karena bakteri tersebut mudah dimanipulasi secara genetika.[2]

Bakteri R. eutropha terbilang relevan dalam industri PHA dan bioproduk lainnya karena memiliki sifat-sifat berikut:

  • Dapat direkayasa genetika. Hal ini mempermudah mencari galur unggul produksi bioproduk[2]
  • Mampu mengggunakan berbagai sumber karbon dalam jangkauan yang luas. R. eutropha mampu menggunakan substrat karbon yang relatif murah untuk produksi bioproduk, sehingga ongkos produksi dapat ditekan[2]
  • Memiliki metabolisme penyimpanan karbon yang kuat, dapat mengakumulasi PHA dalam kemurniann dan produktivitas yang tinggi di dalam sel[2]
  • Bersifat autorof, sehingga dapat mengikat karbon dioksida untuk produksi berbagai bioproduk[2]
  • Tidak patogen, sehingga meningkatkan keamanan pekerja[2]
  • Relatif tahan terhadap beberapa materi beracun, termasuk karbon monoksida[2]

Bioremediasi

[sunting | sunting sumber]

Selain untuk memproduksi PHA, R.eutropha mempunyai aplikasi bioteknologi yang luas.[7][8] Bakteri ini dikenal mampu mendegradasi berbagai senyawa aromatik, sehingga aplikasinya dalam bidang bioremediasi dapat dipertimbangkan.[7] Selain senyawa aromatik, R. eutropha juga pernah dilaporkan mampu mendegradasi senyawa polutan lain seperti formaldehida dan etanatiol.[8][9]

Produksi Bioproduk Lainnya

[sunting | sunting sumber]

R.eutropha juga dikenal secara alami mampu memproduksi enzim yang mempunyai aplikasi industri seperti esterase dan lipase.[10][11] Lebih jauh lagi, rekayasa genetika pada bakteri ini dapat dilakukan untuk menghasilkan berbagai produk yang memiliki nilai tambah.[11] R.eutropha telah berhasil direkayasa untuk produksi isobutanol.[11] R.eutropha juga telah direkayasa hingga mampu memproduksi produksi vanilin yang berperan dalam memperkaya rasa pada produk makanan.[2] Rekayasa genetika R.eutropha untuk produksi asam metilsitrat untuk industri farmasi juga pernah dilaporkan.[12]

Referensi

[sunting | sunting sumber]
  1. ^ a b c d e (Inggris) Vandamme P, Coenye T. (2004). "Taxonomy of the genus Cupriavidus: a tale of lost and found". International journal of systematic and evolutionary microbiology. 54 (6): 2285–2289. doi:10.1099/ijs.0.63247-0. Diakses tanggal 6 April 2014. 
  2. ^ a b c d e f g h i j k (Inggris) Brigham CJ, Zhila N, Shishatskaya E, Volova TG, Sinskey AJ. 2012. Chapter 17: Manipulation of Ralstonia eutropha Carbon Storage Pathways to Produce Useful Bio-Based Products. Di Dalam: Wang X, Chen J Quinn PJ. 2012. Reprogramming Microbial Metabolic Pathways. Dordrecht: Springer.
  3. ^ a b (Inggris) Ramos JL, Levesque LC. (2006). Pseudomonas: Volume 4: Molecular Biology of Emerging Issues. Springer. ISBN 0-306-48378-5, 9780306483783. 
  4. ^ a b c d e f (Inggris) Pohlmann A; et al. (2006). "Genome sequence of the bioplastic-producing "Knallgas" bacterium Ralstonia eutropha H16". Nature biotechnology. 24 (10): 1257–1262. doi:10.1038/nbt1244. Diakses tanggal 6 April 2014. 
  5. ^ (Inggris) Cramm R (2009). "Genomic view of energy metabolism in Ralstonia eutropha H16". Journal of molecular microbiology and biotechnology. 16 (1-2): 38–52. doi:10.1159/000142893. Diakses tanggal 6 April 2014. 
  6. ^ (Inggris) Lykidis A; et al. (2010). "The complete multipartite genome sequence of Cupriavidus necator JMP134, a versatile pollutant degrader". PloS one. 5 (3): e9729. doi:10.1371/journal.pone.0009729. Diakses tanggal 6 April 2014. 
  7. ^ a b (Inggris) Park JM, Kim TY, Lee SY. 2011. Genome-scale reconstruction and in silico analysis of Ralstonia eutropha H16 for polyhydroxyalkanoate synthesis, lithoautothrophic growth, and 2-methyl citric acid production. BMC System Biol 5: DOI: 101-113.10.1186/1752-0509-5-101
  8. ^ a b (Inggris)Sedighi M, Vahabzadeh F, Morteza F, Naderifar A. 2013. Ethanatiol degradation by Ralstonia eutropha. Biotech Bioprocess Eng 18: 827-833.
  9. ^ (Inggris)Habibi A, Vahabzadeh F. 2012. Degradation of formaldehide in packed-bed immobilized Ralstonia eutropha. Biotechnol Bioprocess Eng 18: 455-464.doi:10.1007/s12257-012-0200-5
  10. ^ (Inggris)Song S, Hein S, Steinbuchel A. 2000. Cloning, nucleotide sequence and primary biochemical characterization of esterase EstA from Ralstonia eutropha CH34. Biotechnol let 22: 444-449.
  11. ^ a b c (Inggris) Lu J, Bringham CJ, Rha C, Sinskey AJ. 2013 Characterization of extracellular lipase and its chaperone from Ralstonia eutropha H16. Appl Microbiol Biotechnol 97: 2443-2454.doi:10.1007/s00253-012-4115-z
  12. ^ (Inggris) Ewerwing C, Heuser F, Benolken JK, Bramer CO, Steinbuchel A. 2006. Metabolic engineering of strains of Ralstonia eutropha and Pseudomonas putida for biotechnological production of 2-methylcitric acid. Metab Eng 8: 587-602.

Pranala luar

[sunting | sunting sumber]
Diperoleh dari "https://wiki-indonesia.club/w/index.php?title=Ralstonia_eutropha&oldid=22535817"