Metaloproteinase matriks: Perbedaan antara revisi
Tidak ada ringkasan suntingan |
|||
Baris 23: | Baris 23: | ||
| '''Gen''' || '''Nama''' || '''Lokasi''' || '''Deskripsi''' |
| '''Gen''' || '''Nama''' || '''Lokasi''' || '''Deskripsi''' |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP1]] || Interstitial collagenase || sekresi || |
| [[Metaloproteinase matriks-1|MMP1]] || Interstitial collagenase || sekresi || Substrat termasuk Col I, II, III, VII, VIII, X, gelatin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP2]] || Gelatinase-A, 72 [[kilodalton|kDa]] gelatinase || sekresi || |
| [[Metaloproteinase matriks-2|MMP2]] || Gelatinase-A, 72 [[kilodalton|kDa]] gelatinase || sekresi || Substrat termasuk Gelatin, Col I, II, III, IV, Vii, X |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP3]] || Stromelysin 1 || sekresi || |
| [[Metaloproteinase matriks-3|MMP3]] || Stromelysin 1 || sekresi || Substrat termasukCol II, IV, IX, X, XI, gelatin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP7]] || Matrilysin, PUMP 1 || sekresi || |
| [[Metaloproteinase matriks-7|MMP7]] || Matrilysin, PUMP 1 || sekresi || terkait membran melalui pengikatan pada kolesterol sulfat pada membran sel, substrat termasuk: fibronectin, laminin, Col IV, gelatin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP8]] || Neutrophil collagenase || sekresi || |
| [[MMP8]] || Neutrophil collagenase || sekresi || Substrat termasuk Col I, II, III, VII, VIII, X, aggrecan, gelatin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP9]] || Gelatinase-B, 92 kDa gelatinase || sekresi || |
| [[Metaloproteinase matriks-9|MMP9]] || Gelatinase-B, 92 kDa gelatinase || sekresi || Substrat termasuk Gelatin, Col IV, V |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP10]] || Stromelysin 2 || sekresi || |
| [[MMP10]] || Stromelysin 2 || sekresi || Substrat termasuk Col IV, laminin, fibronectin, elastin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP11]] || Stromelysin 3 || sekresi || MMP-11 |
| [[MMP11]] || Stromelysin 3 || sekresi || MMP-11 menunjukkan lebih serupa dengan MT-MMPs, yaitu convertase-activatable dan disekresikan dikarenakan biasanya berkaitan dengan convertase-activatable MMP. Substrat termasuk Col IV, fibronectin, laminin, aggrecan |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP12]] || Macrophage metalloelastase || sekresi || |
| [[MMP12]] || Macrophage metalloelastase || sekresi || Substrat termasuk elastin, fibronectin, Col IV |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP13]] || Collagenase 3 || sekresi || |
| [[MMP13]] || Collagenase 3 || sekresi || Substrat termasuk Col I, II, III, IV, IX, X, XIV, gelatin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP14]] || MT1-MMP || |
| [[MMP14]] || MT1-MMP || terkait membran || MMP transmembran tipe I; substrat termasuk gelatin, fibronectin, laminin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP15]] || MT2-MMP || |
| [[MMP15]] || MT2-MMP || terkait membran || MMP transmembran tipe I; substrat termasuk gelatin, fibronectin, laminin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP16]] || MT3-MMP || |
| [[MMP16]] || MT3-MMP || terkait membran || MMP transmembran tipe I; substrat termasuk gelatin, fibronectin, laminin |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP17]] || MT4-MMP || |
| [[MMP17]] || MT4-MMP || terkait membran || [[GPI anchor|glycosyl phosphatidylinositol]]-attached; substrat termasuk fibrinogen, fibrin |
||
|- |
|- |
||
| ''MMP18'' || Collagenase 4, xcol4, [[xenopus]] collagenase || – || |
| ''MMP18'' || Collagenase 4, xcol4, [[xenopus]] collagenase || – || Tidak diketahui [[ortolog]] manusia |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP19]] || RASI-1, |
| [[MMP19]] || RASI-1, kadang-kadang diasosiasikan dengan stromelysin-4 || – || |
||
|- |
|- |
||
| [[MMP20]] || Enamelysin || sekresi || |
| [[MMP20]] || Enamelysin || sekresi || |
Revisi per 20 Desember 2016 08.28
Metaloproteinase matriks (MMP) juga dikenal sebagai matriksin, adalah endopeptidase mengandung seng tergantung kalsium;[1] anggota keluarga lainnya adalah adamalisin, serralisin, dan astacin. MMP adalah keluarga besar protease dikenal sebagai superfamili metzincin.[2]
Secara kolektif, enzim ini mampu mendegradasi semua jenis protein matriks ekstraselular, tetapi juga dapat memproses sejumlah molekul bioaktif. Mereka diketahui terlibat dalam pembelahan reseptor permukaan sel, pelepasan ligan apoptosis (seperti ligan FAS), dan inaktivasi kemokin/sitokin.[3] MMP juga dipertimbangakn memainkan peran utama dalam perilaku sel seperti proliferasi sel, migrasi (adhesi/dispersi), diferensiasi, angiogenesis, apoptosis, dan pertahanan inang.
MMP pertama kali dijelaskan pada vertebrata (1962),[4] termasuk manusia, tetapi telah ditemukan dalam invertebrata dan tanaman. Mereka dibedakan dari endopeptidase lain dengan ketergantungan mereka pada ion logam sebagai kofaktor, kemampuan mereka untuk mendegradasi matriks ekstraselular, dan urutan DNA evolusi spesifik.
Sejarah
MMP dideskripsikan awalnya oleh Jerome Gross dan Charles Lapiere (1962), yang mengamati aktivitas enzimatik (degradasi kolagen heliks tiga) selama metamorfosis ekor kecebong (dengan menempatkan ekor kecebong dalam piring matriks kolagen).[5] Oleh karena itu, enzim bernama kolagenase interstitial (MMP-1).
Kemudian, dimurnikan dari kulit manusia (1968), [6] dan dikenali disintesis sebagai zimogen.[6] and was recognized to be synthesized as a zymogen.[7]
"Sistein switch" digambarkan pada tahun 1990.[8]
Struktur
MMP memiliki struktur domain umum. Tiga domain umum adalah pro-peptida, domain katalitik, dan domain C-terminal mirip haemopexin, yang terkait dengan domain katalitik oleh daerah engsel yang fleksibel.[2]
Klasifikasi
MMP dapat dibagi dengan cara yang berbeda.
Gen
Gen | Nama | Lokasi | Deskripsi |
MMP1 | Interstitial collagenase | sekresi | Substrat termasuk Col I, II, III, VII, VIII, X, gelatin |
MMP2 | Gelatinase-A, 72 kDa gelatinase | sekresi | Substrat termasuk Gelatin, Col I, II, III, IV, Vii, X |
MMP3 | Stromelysin 1 | sekresi | Substrat termasukCol II, IV, IX, X, XI, gelatin |
MMP7 | Matrilysin, PUMP 1 | sekresi | terkait membran melalui pengikatan pada kolesterol sulfat pada membran sel, substrat termasuk: fibronectin, laminin, Col IV, gelatin |
MMP8 | Neutrophil collagenase | sekresi | Substrat termasuk Col I, II, III, VII, VIII, X, aggrecan, gelatin |
MMP9 | Gelatinase-B, 92 kDa gelatinase | sekresi | Substrat termasuk Gelatin, Col IV, V |
MMP10 | Stromelysin 2 | sekresi | Substrat termasuk Col IV, laminin, fibronectin, elastin |
MMP11 | Stromelysin 3 | sekresi | MMP-11 menunjukkan lebih serupa dengan MT-MMPs, yaitu convertase-activatable dan disekresikan dikarenakan biasanya berkaitan dengan convertase-activatable MMP. Substrat termasuk Col IV, fibronectin, laminin, aggrecan |
MMP12 | Macrophage metalloelastase | sekresi | Substrat termasuk elastin, fibronectin, Col IV |
MMP13 | Collagenase 3 | sekresi | Substrat termasuk Col I, II, III, IV, IX, X, XIV, gelatin |
MMP14 | MT1-MMP | terkait membran | MMP transmembran tipe I; substrat termasuk gelatin, fibronectin, laminin |
MMP15 | MT2-MMP | terkait membran | MMP transmembran tipe I; substrat termasuk gelatin, fibronectin, laminin |
MMP16 | MT3-MMP | terkait membran | MMP transmembran tipe I; substrat termasuk gelatin, fibronectin, laminin |
MMP17 | MT4-MMP | terkait membran | glycosyl phosphatidylinositol-attached; substrat termasuk fibrinogen, fibrin |
MMP18 | Collagenase 4, xcol4, xenopus collagenase | – | Tidak diketahui ortolog manusia |
MMP19 | RASI-1, kadang-kadang diasosiasikan dengan stromelysin-4 | – | |
MMP20 | Enamelysin | sekresi | |
MMP21 | X-MMP | sekresi | |
MMP23A | CA-MMP | terkait membran | type-II transmembrane cysteine array |
MMP23B | – | terkait membran | type-II transmembrane cysteine array |
MMP24 | MT5-MMP | terkait membran | MMP transmembran jenis 1 |
MMP25 | MT6-MMP | terkait membran | glycosyl phosphatidylinositol-attached |
MMP26 | Matrilysin-2, endometase | – | |
MMP27 | MMP-22, C-MMP | – | |
MMP28 | Epilysin | sekresi | Ditemukan tahun 2001 dan diberi nama demikian karena telah ditemukan di keratinosit manusia. Tidak seperti MMP lainnya enzim ini diekspresikan secara konstitutif dalam banyak jaringan (Diekspresikan tinggi dalam testis dan pada tingkat yang lebih rendah di paru-paru, jantung, otak, usus besar, usus, plasenta, kelenjar ludah, rahim, kulit). Sebuah treonin menggantikan prolin dalam switch sistein nya (PRCGVTD)[9] |
Referensi
- ^ Verma RP, Hansch C (March 2007). "Matrix metalloproteinases (MMPs): chemical-biological functions and (Q)SARs" (PDF). Bioorg. Med. Chem. 15 (6): 2223–68. doi:10.1016/j.bmc.2007.01.011. PMID 17275314.
- ^ a b Matrix Metalloproteinases: Its implications in cardiovascular disorders
- ^ Van Lint P, Libert C (December 2007). "Chemokine and cytokine processing by matrix metalloproteinases and its effect on leukocyte migration and inflammation". J. Leukoc. Biol. 82 (6): 1375–81. doi:10.1189/jlb.0607338. PMID 17709402.
- ^ "Collagenolytic activity in amphibian tissues: a tissue culture assay". Proceedings of the National Academy of Sciences. 48 (6): 1014–22. June 1962. doi:10.1073/pnas.48.6.1014. PMC 220898 . PMID 13902219.
- ^ Gross J, Lapiere C (1962). "COLLAGENOLYTIC ACTIVITY IN AMPHIBIAN TISSUES: A TISSUE CULTURE ASSAY". Proc Natl Acad Sci USA. 48 (6): 1014–22. doi:10.1073/pnas.48.6.1014. PMC 220898 . PMID 13902219.
- ^ Eisen A, Jeffrey J, Gross J (1968). "Human skin collagenase. Isolation and mechanism of attack on the collagen molecule". Biochim Biophys Acta. 151 (3): 637–45. doi:10.1016/0005-2744(68)90010-7. PMID 4967132.
- ^ Harper E, Bloch K, Gross J (1971). "The zymogen of tadpole collagenase". Biochemistry. 10 (16): 3035–41. doi:10.1021/bi00792a008. PMID 4331330.
- ^ Van Wart H, Birkedal-Hansen H (1990). "The cysteine switch: a principle of regulation of metalloproteinase activity with potential applicability to the entire matrix metalloproteinase gene family". Proc Natl Acad Sci USA. 87 (14): 5578–82. doi:10.1073/pnas.87.14.5578. PMC 54368 . PMID 2164689.
- ^ Lohi J, Wilson CL, Roby JD, Parks WC (2001). "Epilysin, a novel human matrix metalloproteinase (MMP-28) expressed in testis and keratinocytes and in response to injury". J Biol Chem. 276 (13): 10134–10144. doi:10.1074/jbc.M001599200. PMID 11121398.