Primer DNA: Perbedaan antara revisi
Tidak ada ringkasan suntingan Tag: BP2014 |
Wagino Bot (bicara | kontrib) k →top: minor cosmetic change |
||
| Baris 1: | Baris 1: | ||
'''Primer DNA''' adalah sekuens [[DNA]] yang komplemen terhadap sekuens yang akan diamplifikasi, terutama dalam [[reaksi berantai polimerase]] (PCR) <ref name="Carson & Robertson"> {{en}} {{cite book|author=Carson S, Robertson D| |
'''Primer DNA''' adalah sekuens [[DNA]] yang komplemen terhadap sekuens yang akan diamplifikasi, terutama dalam [[reaksi berantai polimerase]] (PCR) <ref name="Carson & Robertson"> {{en}} {{cite book|author=Carson S, Robertson D|title = Manipulation and Expression of Recombinant DNA: A Laboratory Manual|publisher = Elsevier, Burlington|year=2006|}} </ref>. Batasannya, primer ini akan menempel pada kedua ujung sekuens DNA yang ingin diamplifikasi dengan arah yang berkebalikan (utas ''sense'' dan ''antisense'') <ref name="Carson & Robertson"/>. Dalam suatu reaksi berantai polimerase digunakan dua primer, yaitu primer maju dan primer mundur <ref name="Carson & Robertson"/>. Kedua primer ini harus ada dalam reaksi polimerasi agar amplifikasi DNA terjadi <ref name="Carson & Robertson"/>. |
||
Molekul primer dapat berupa molekul DNA, [[RNA]], atau bahkan [[protein]] spesifik <ref name = "Johsi et al"> {{en}} {{cite journal | author= Joshsi J, Manandhar L, Shrestha P, Gupta R, Manadhar R, Shrestha S| title = Random amplification of polimorphic DNA analysis for genetic characterization of two breeds of dogs, German Shepherd and Japanese Spitz| journal = Nepal J Sci Technol | volume=13|issue=2|page=73-78|year=2012}}</ref>. Biasanya, primer yang digunakan pada PCR adalah molekul DNA <ref name = "Johsi et al"/>. Pada akhir proses PCR akan terdapat sejumlah besar fragmen-fragmen pendek DNA hasil amplifikasi <ref name = "Johsi et al"/>. Setelah dilakukan amplifikasi, terdapat berbagai cara untuk melihat hasilnya <ref name = "Johsi et al"/>. Salah satu diantaranya adalah [[elektroforesis gel]] <ref name = "Johsi et al"/>. |
Molekul primer dapat berupa molekul DNA, [[RNA]], atau bahkan [[protein]] spesifik <ref name = "Johsi et al"> {{en}} {{cite journal | author= Joshsi J, Manandhar L, Shrestha P, Gupta R, Manadhar R, Shrestha S| title = Random amplification of polimorphic DNA analysis for genetic characterization of two breeds of dogs, German Shepherd and Japanese Spitz| journal = Nepal J Sci Technol | volume=13|issue=2|page=73-78|year=2012}}</ref>. Biasanya, primer yang digunakan pada PCR adalah molekul DNA <ref name = "Johsi et al"/>. Pada akhir proses PCR akan terdapat sejumlah besar fragmen-fragmen pendek DNA hasil amplifikasi <ref name = "Johsi et al"/>. Setelah dilakukan amplifikasi, terdapat berbagai cara untuk melihat hasilnya <ref name = "Johsi et al"/>. Salah satu diantaranya adalah [[elektroforesis gel]] <ref name = "Johsi et al"/>. |
||
Revisi per 15 Maret 2016 16.19
Primer DNA adalah sekuens DNA yang komplemen terhadap sekuens yang akan diamplifikasi, terutama dalam reaksi berantai polimerase (PCR) [1]. Batasannya, primer ini akan menempel pada kedua ujung sekuens DNA yang ingin diamplifikasi dengan arah yang berkebalikan (utas sense dan antisense) [1]. Dalam suatu reaksi berantai polimerase digunakan dua primer, yaitu primer maju dan primer mundur [1]. Kedua primer ini harus ada dalam reaksi polimerasi agar amplifikasi DNA terjadi [1]. Molekul primer dapat berupa molekul DNA, RNA, atau bahkan protein spesifik [2]. Biasanya, primer yang digunakan pada PCR adalah molekul DNA [2]. Pada akhir proses PCR akan terdapat sejumlah besar fragmen-fragmen pendek DNA hasil amplifikasi [2]. Setelah dilakukan amplifikasi, terdapat berbagai cara untuk melihat hasilnya [2]. Salah satu diantaranya adalah elektroforesis gel [2].
Primer Maju dan Primer Mundur
Primer maju (forward) dan primer mundur (reverse) bekerja berlawanan arah.
Visualisasi
Visualisasi dengan elektroforesis gel dapat dilakukan setelah proses amplifikasi terjadi untuk melihat hasil DNA yang terbentuk [2]. Apabila terdapat delesi untuk suatu lokasi templat, akan terjadi polimorfisme [2]. Dengan elektroforesis gel, akan terlihat pita yang terputus-putus apabila terdapat polimorfisme [2].
Referensi
- ^ a b c d (Inggris) Carson S, Robertson D (2006). Manipulation and Expression of Recombinant DNA: A Laboratory Manual. Elsevier, Burlington.
- ^ a b c d e f g h (Inggris) Joshsi J, Manandhar L, Shrestha P, Gupta R, Manadhar R, Shrestha S (2012). "Random amplification of polimorphic DNA analysis for genetic characterization of two breeds of dogs, German Shepherd and Japanese Spitz". Nepal J Sci Technol. 13 (2): 73-78.