SYBR Hijau I

SYBR Hijau I

Nama
Nama IUPAC N',N'-dimethyl-N-[4-[(E)-(3-methyl-1,3-benzothiazol-2-ylidene)methyl]-1-phenylquinolin-1-ium-2-yl]-N-propylpropane-1,3-diamine
Penanda
Nomor CAS	163795-75-3
3DMet	{{{3DMet}}}
Nomor EC
PubChem CID	10436340
Nomor RTECS	{{{value}}}
CompTox Dashboard (EPA)	DTXSID60936871
Sifat
Rumus kimia	C32H37N4S+
Massa molar	509.73 g·mol−1
Kelarutan	Soluble in Dimethylsulfoxide
Kecuali dinyatakan lain, data di atas berlaku pada suhu dan tekanan standar (25 °C [77 °F], 100 kPa).
Referensi

SYBR® Green merupakan suatu senyawa yang biasa digunakan untuk mewarnai DNA karena kemampuannya sebagai interkalat yaitu menyisip diantara basa-basa nitrogen pada DNA. senyawa ini hanya dapat berfluorescent secara maksimal jika berikatan dengan DNA utas ganda.

Pada larutan normal (tanpa DNA) senyawa ini akan berfluorescent dalam jumlah sedikit. akan tetapi jika sejumlah DNA ditambahkan dalam larutan, maka SYBR® Green akan langsung berikatan dengan DNA utas ganda dan langsung meningkatkan kemampuan fluorescentnya hingga 1000 kali. jadi semakin besar konsentrasi DNA dalam larutan, semakin terang pendaran yang dihasilkan.

Kelebihan

Stabil dalam beberapa temperatur

Hal tersebut sangat menguntungkan karena beberapa reaksi misalnya reaksi PCR dilakukan dalam suhu yang bervariasi.

Ikatan yang dibentuk

Ikatan yang dibentuk antara molekul SYBR Green dengan DNA bukan merupakan ikatan kovalen. Hal tersebut mengakibatkan zat warna ini tidak akan mengganggu kerja enzim nuklease dan polimerase.

Aplikasi

Real-Time PCR

SYBR Green biasa digunakan dalam real-time PCR karena sifatnya yg stabil dalam berbagai suhu dan karena sifat fluorescentnya yang hanya muncul jika berikatan dengan DNA utas tunggal.