Daftar bandar udara tujuan Merpati Nusantara Airlines
Ini adalah daftar bandar udara tujuan maskapai penerbangan Merpati Nusantara Airlines.
- Alor - Bandar Udara Mali
- Amahai - Bandar Udara Amahai
- Balikpapan - Bandar Udara Internasional Sepinggan
- Bajawa
- Bandung - Bandar Udara Internasional Husein Sastranegara
- Banjarmasin - Bandar Udara Syamsudin Noor
- Banyuwangi
- Batam - Bandar Udara Hang Nadim
- Biak - Bandar Udara Frans Kaisiepo
- Bima - Bandar Udara Bima
- Bintuni - Bandar Udara Bintuni
- Buol - Bandar Udara Buol
- Denpasar - Bandar Udara Internasional Ngurah Rai Hub
- Ende - Bandar Udara H. Hasan Aroeboesman
- Gorontalo - Bandar Udara Jalaluddin
- Jakarta
- Bandar Udara Halim Perdanakusuma Hub kedua
- Bandar Udara Internasional Soekarno-Hatta Hub utama
- Jayapura - Bandar Udara Sentani
- Kaimana - Bandar Udara Kaimana
- Kambuaya - Bandar Udara Kambuaya
- Karubaga - Bandar Udara Karubaga
- Kebar - Bandar Udara Kebar
- Kendari - Bandar Udara Wolter Monginsidi
- Kepi - Bandar Udara Kepi
- Kimam - Bandar Udara Kimam
- Kisar - Bandar Udara Kisar
- Kupang - Bandar Udara El Tari
- Labuan Bajo - Komodo Airport
- Labuha - Usman Sadik Airport
- Langgur - Dumatubin Airport
- Larantuka - Gewayentana Airport
- Luwuk - Bandar Udara Luwuk
- Makassar - Bandar Udara Internasional Sultan Hasanuddin Hub
- Mamuju - Bandar Udara Mamuju
- Manado - Bandar Udara Internasional Sam Ratulangi
- Mangole - Bandar Udara Mangole
- Manokwari - Bandar Udara Rendani
- Mataram - Bandar Udara Internasional Lombok
- Maumere - Bandar Udara Wai Oti
- Medan - Bandar Udara Internasional Polonia
- Melangguane - Bandar Udara Melanggguane
- Merauke - Mopah Airport
- Merdei - Merdei Airport
- Meulaboh - Meulaboh Airporrt
- Mulia - Mulia Airport
- Nabire
- Namlea - Namlea Airport
- Namrole - Namrole Airport
- Nias - Binaka Airport
- Okaba - Okaba Airport
- Oksibil - Oksibil Airport
- Padang - Bandar Udara Internasional Minangkabau
- Palembang - Bandar Udara Internasional Sultan Mahmud Badaruddin II
- Palu - Mutiara Airport
- Pangkal Pinang - Depati Amir Airport
- Poso - Kasiguncu Airport
- Ruteng - Ruteng Airport
- Sampit - Sampit Airport
- Sanana - Sanana Airport
- Sarmi - Sarmi Airport
- Saumlaki - Saumlaki Airport
- Sawu - Sawu Airport
- Senngo - Senggo Airport
- Sibolga - Sibolga Airport
- Sinabang - Sinabang Airport
- Sinak[[{{{1}}}|{{{1}}}]]
- Sinak Airport - Semarang - Achmad Yani International Airport
- Sorong - Sorong Airport
- Surabaya - Juanda International Airport Hub
- Tanah Merah - Tanah Merah Airport
- Tanjung Karang - Radin Inten II Airport
- Tarakan - Juwata International Airport
- Teminabuan - Teminabuan Airport
- Ternate - Babullah Airport
- Timika - Timika Airport
- Tiom - Tiom Airport
- Tolitoli - Tolitoli Airport
- Waingapu - Waingapu Airport
- Wamena - Mau Hau Airport
- Yogyakarta - Adisucipto International Airport
