Histon H2B
Histon H2B adalah salah satu dari lima protein histon utama yang terlibat di struktur kromatin sel eukariot. Histon ini memiliki sebuah domain globular utama dan ekor ujung-N dan ujung-C yang panjang. H2B terlibat dengan struktur nukleosom.[1]
Struktur
Histon H2B adalah protein struktur ringan yang terbuat dari 126 asam amino.[2] Kebanyakan asam amino histon H2B memiliki muatan positif di pH sel sehingga memungkinkan mereka untuk berinteraksi dengan gugus fosfat DNA yang bermuatan negatif.[3] Selain domain globular di tengah, histon H2B juga memiliki dua ekor histon fleksibel Artikel dengan pernyataan yang tidak disertai rujukan[dibutuhkan verifikasi sumber] yang mengarah keluar – satu di ujung-N dan satu lagi di ujung-C.
Setiap dua salinan histon H2B selalu hadir bersama dua kopi dari masing-masing histon H2A, histon H3, dan histon H4 untuk membentuk inti oktamer dari nukleosom[2] yang memberikan struktur ke DNA.[3] Dalam rangka memfasilitasi pembentukan inti oktamer tadi, histon H2B akan menempel ke histon H2A untuk membentuk heterodimer.[2] Kedua heterodimer tadi akan menempel dengan heterotretamer yang terbuat dari histon H3 dan histon H4 sehingga memberikan karakteristik nukleosom yang berbentuk piringan.[3] Kemudian, DNA akan membungkus keseluruhan nukleosom dalam bagian-bagian berukuran sekitar 160 pasang basa DNA.[1] Proses pembungkusan akan berlanjut hingga seluruh kromatin terbungkus dengan nukleosom.[4]
Fungsi
Respon kerusakan DNA
Inisiasi perbaikan kerusakan DNA secara tepat waktu dipengaruhi oleh ubikitinasi histon H2B.[5] Ubikitinasi RNF20/RNF40 secara spesifik memodifikasi histon H2B di posisi K120. Modifikasi tadi diperlukan untuk merekrut faktor-faktor yang terlibat dalam perbaikan DNA dengan jalur rekombinasi homolog dan penggabungan ujung nonhomolog.
Genetika
Sekuens asam amino dari Histon H2B sangat terkonservasi dalam proses evolusi. Spesies yang bersaudara jauh sekalipun memiliki protein histon yang sangat mirip. [3] Keluarga histon H2B terdiri dari 214 anggota dari berbagai spesies. Pada manusia, histon H2B dikode oleh 23 gen berbeda[6] tanpa intron.[2] Keseluruhan gen terletak di kluster histon di kromosom 6 serta kluster 2 dan kluster 3 di kromosom 1. Di tiap kluster gennya, gen histon H2B berbagi promotor dengan sekuens yang mengkode histon H2A. Walaupun seluruh gen di kluster histon ditranskripsi pada level yang tinggi selama fase-S, masing-masing gen histon H2B juga dieksperisikan pada fase lain selama siklus sel.
Referensi
- ^ a b Bhasin M, Reinherz EL, Reche PA (2006). "Recognition and classification of histones using support vector machine" (PDF). Journal of Computational Biology. 13 (1): 102–12. doi:10.1089/cmb.2006.13.102. PMID 16472024.
- ^ a b c d Rønningen T, Shah A, Oldenburg AR, Vekterud K, Delbarre E, Moskaug JØ, Collas P (December 2015). "Prepatterning of differentiation-driven nuclear lamin A/C-associated chromatin domains by GlcNAcylated histone H2B". Genome Research. 25 (12): 1825–35. doi:10.1101/gr.193748.115. PMC 4665004
. PMID 26359231.
- ^ a b c d Lodish HF, Berk A, Kaiser C, Krieger M, Bretscher A, Ploegh HL, Amon A, Scott MP (2013). Molecular Cell Biology (edisi ke-Seventh). New York: Freeman. hlm. 258–328. ISBN 978-1-4292-3413-9.
- ^ Molden RC, Bhanu NV, LeRoy G, Arnaudo AM, Garcia BA (2015). "Multi-faceted quantitative proteomics analysis of histone H2B isoforms and their modifications". Epigenetics & Chromatin. 8 (15): 15. doi:10.1186/s13072-015-0006-8 . PMC 4411797 . PMID 25922622.
- ^ Uckelmann M, Sixma TK. Histone ubiquitination in the DNA damage response. DNA Repair (Amst). 2017 Aug;56:92-101. doi: 10.1016/j.dnarep.2017.06.011. Epub 2017 Jun 9. PMID: 28624371
- ^ Khare SP, Habib F, Sharma R, Gadewal N, Gupta S, Galande S. "Histone H2B". HIstome: A Relational Knowledgebase of Human Proteins and Histone Modifying Enzymes. Nucleic Acids Research. Diarsipkan dari versi asli tanggal 16 October 2016. Diakses tanggal 24 November 2015.
