Lompat ke isi

Serpin

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Serpin (serine protease inhibitor)
Sebuah molekul serpin (putih) dengan 'loop pusat reaktif'-nya (biru) terikat dengan protease (abu-abu). Ketika protease mencoba mengkatalisis enzim, maka ia akan dihambat secara irreversibel. (PDB: 1K9O​)
Identifikasi
SimbolSerpin, SERPIN (root symbol of family)
PfamPF00079
InterProIPR000215
PROSITEPDOC00256
SCOP1hle
SUPERFAMILY1hle
CDDcd00172

Serpin atau Serine Protease Inhibitor adalah sebuah kelompok besar protein yang bekerja sebagai penghambat protease dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak tersebar pada makhluk hidup. Gen yang menyerupai serpin telah ditemukan pada binatang, tumbuhan, virus pox dan bakteri. Serpin bekerja dengan cara mengubah bentuk untuk menghambat enzim target.[1]

Struktur

Serpin terdiri dari 350-400 asam amino dan memiliki berat molekul 40-50 kDa. Penyusunnya adalah 3 lembaran beta (A, B, C) dan 8-9 heliks alfa (hA-hI).[2]

Sebagai penghambat protease, serpin memiliki struktur lingkaran yang berguna untuk berhubungan dengan celah aktif protease. Berbeda dengan penghambat protease serin lainnya yang memiliki lingkaran pusat reaktif (LPR) yang pendek dan kaku, serpin memiliki LPR yang panjang dan lentur.[3]

Pembagian

Serpin dibagi dalam beberapa clade yaitu:[4][5]

  • Clade A (Antitripsin-like)
  • Clade B (Ovalbumin-like)
  • Clade C (Antitrombin)
  • Clade D (Heparin Kofaktor II)
  • Clade E (PAI-1/GDN)
  • Clade F (PEDF)
  • Clade G (Penghambat C1)
  • Clade H (Protein peredam panas 47)
  • Clade I (Neuroserpin)
  • Clade J (Belangkas)
  • Clade K (Serangga)
  • Clade L (Nematoda)
  • Clade M (Schistosoma)
  • Clade N (Viral SPI1-2/Crm-A-like)
  • Clade O (Viral SPI3-like)
  • Clade P (Tumbuhan)

Persebaran

Serpin terdapat pada semua makhluk hidup eukariota seperti binatang dan tumbuhan kecuali jamur dan klorofita. Serpin juga dapat ditemukan pada sebagian bakteri dan virus yang menginfeksi makhluk hidup eukariota.

Virus

Sejauh ini serpin baru ditemukan pada virus poxviridae. Serpin dari cabang Orthopoxvirus (pox sapi, ectromelia, vaccinia, variola dan pox kelinci) tergabung dalam 2 clade, yaitu clade n, mengandung serpin SPI-1-like dan SPI-2-like, dan clade o, mengandung serpin SPI-3-like.

Chordata

Serpin pada eukariota yang lebih tinggi dapat dibagi menjadi 2 kelompok besar, yaitu serpin intraselulkar (serpin-ov) dan serpin ekstraselular. Serpin-ov membentuk clade (b) dan merupakan nenek moyang dari serpin ekstraseluler.

Sedangkan serpin ekstraselular dapat dibagi ke dalam 8 clade, yang paling besar adalah clade a. Serpin dalam kelompok ini terlibat dalam banyak proses, paling umum adalah penghambatan proteinase serin.[6]

Manusia

Sampai saat ini serpin yang ditemukan pada manusia berjumlah 34 buah yang berasal dari sembilan clade. Serpin pada manusia berfungsi dalam proses penggumpalan darah, fibrinolisis dan peradangan. Sebanyak 7 serpin pada manusia tidak berfungsi sebagai penghambat proteinase.[7]

Nama Gen Nama Umum Letak Fungsi
SERPINA1 Alpha-1 antitripsin Ekstraselular Menghambat elastase neutrofil
SERPINA2 Protein terkait Antitripsin Extracellular Kemungkinan pseudogen
SERPINA3 Alpha 1-antichymotrypsin Ekstracellular Menghambat katepsin G
SERPINA4 Kallistatin Extracellular Menghambat kalikrein
SERPINA5 Protein C inhibitor Extracellular Menghambat protein C aktif
SERPINA6 Transcortin Extracellular Mengikat kortisol
SERPINA7 Thyroxine-binding globulin Extracellular Mengikat tiroksin
SERPINA8 Angiotensinogen Extracellular Memotong amino-terminal dengan renin protease mengakibatkan pelepasan angiotensin I
SERPINA9 Centerin / GCET1 Extracellular Memelihara sel B naive
SERPINA10 Protein Z-related protease inhibitor Extracellular Menghambat faktor Z dan XI teraktivasi
SERPINA11 Extracellular
SERPINA12 Vaspin Extracellular Adipositokin pemeka insulin
SERPINA13 Extracellular Menghambat elastase neutrofil
SERPINB1 Intracellular Menghambat uPA
SERPINB2 Intracellular/extracellular Menghambat katepsin L dan V
SERPINB3 Intracellular Menghambat katepsin G dan kimase
SERPINB4 Intracellular Menghambat metastasis
SERPINB5 Maspin Intracellular Menghambat katepsin G
SERPINB6 PI-6 Intracellular Pematangan megakariosit
SERPINB7 Megsin Intracellular Menghambat furin
SERPINB8 PI-8 Intracellular Menghambat granzim B
SERPINB9 PI-9 Intracellular Menghambat trombin dan tripsin
SERPINB10 Bomapin Intracellular -
SERPINB11 Intracellular Menghambat tripsin
SERPINB12 Yukopin Intracellular Menghambat katepsin L dan K
SERPINB13 Hurpin/Headpin Intracellular Menghambat trombin dan faktor Xa
SERPINC1 Antithrombin Extracellular Menghambat trombin
SERPIND1 Heparin cofactor II Extracellular Menghambat trombin, uPA, tPA dan plasmin
SERPINE1 Extracellular Menghambat uPA dan tPA
SERPINE2] Ekstracellular
SERPINF1 Extracellular Molekul anti-angiogenik poten
SERPINF2 Extracellular Penghambat plasmin
SERPING1 C1-inhibitor Extracellular Penghambat esterase C1
SERPINH1 Intracellular Molekul Kaperon untuk kolagen
SERPINI1 Neuroserpin Extracellular Penghambat tPA, uPA dan plasmin
SERPINI2 Pancpin Extracellular Menghambat metastasis kanker

Sumber

  1. ^ An overview of the serpin superfamily
  2. ^ Serpin Inhibition Mechanism: A Delicate Balance between Native Metastable State and Polymerization
  3. ^ Serpin structure, function and dysfunction
  4. ^ Silverman, Gary A. & Lomas, David A., 2007, hlm. 9-10.
  5. ^ Gettins, Peter G.W., 2002.
  6. ^ Irving JA e (2000). "Phylogeny of the Serpin Superfamily: Implications of Patterns of Amino Acid Conservation for Structure and Function". Genome Research. doi:10.1101/gr.147800.  Galat gaya Vancouver: punctuation (bantuan)
  7. ^ Serpin Structure, Mechanism, and Function
  8. ^ Law RH, Zhang Q, McGowan S, Buckle AM, Silverman GA, Wong W, Rosado CJ, Langendorf CG, Pike RN, Bird PI, Whisstock JC (2006). "An overview of the serpin superfamily". Genome Biology. 7 (5): 216. doi:10.1186/gb-2006-7-5-216. PMC 1779521alt=Dapat diakses gratis. PMID 16737556. 

Buku

  • Silverman, Gary A. & Lomas, David A (2007). Molecular And Cellular Aspects Of The Serpinopathies And Disorders In Serpin Activity (dalam bahasa Inggris). Singapore: World Scientific Publishing. hlm. 9–10. ISBN 978-981-256-963-9.