Teneurin
| Teneurin | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikasi | |||||||||
| Simbol | Teneurin | ||||||||
| Pfam | PF06484 | ||||||||
| InterPro | IPR009471 | ||||||||
| |||||||||
Teneurin adalah suatu protein bitopik atau protein menembus satu kali. Namanya mengacu pada "ten-a" (dari "protein mirip- tenascin, aksesori") dan "neuron", yang merupakan tempat ekspresi utama dari teneurin. Ten-m mengacu pada protein tenascien-like, yang merupakan glikoprotein transmembran tipe II.
Teneurin sangat terkonservasi antara Drosophila, C. elegans, dan vertebrata. Pada setiap spesies, protein diekspresikan oleh subkelompok neuron serta di situs pembentukan pola dan morfogenesis. Pada Drosophila, teneurin yang dikenal sebagai ten-m atau Odz adalah gen pair-rule, dan ekspresinya diperlukan untuk perkembangan normal. Knockdown ekspresi teneurin (ten-1) pada C. elegans dengan RNAi mengarah ke jalur neuron abnormal dan perkembangan gonad abnormal.[1]
Domain intraseluler dari beberapa teneurin dapat dibelah dan diangkut ke inti sel, yang diusulkan untuk bertindak sebagai faktor transkripsi. Suatu peptida yang berasal dari ujung domain ekstraselular berbagi homologi struktural dengan neuropeptida tertentu.
Ada empat gen teneurin dalam vertebrata bernama teneurin-1 hingga -4. Nama-nama lain yang ditemukan dalam literatur termasuk Odz-1 hingga -4 dan Tenm-1 hingga -4.
Homologi
Teneurin merupakan keluarga glikoprotein transmembran yang terkonsentrasi secara filogenetik yang diekspresikan selama pembentukan pola dan morfogenesis.[2]
Sejarah
Awalnya ditemukan sebagai ten-m dan ten-a pada Drosophila melanogaster, famili teneurin dilestarikan dari Caenorhabditis elegans (ten-1) hingga vertebrata, di mana terdapat empat paralog (teneurin-1 hingga -4 atau odz-1 hingga -4). Arsitektur domain protein mereka yang berbeda sangat dijaga antara teneurin invertebrata dan vertebrata, khususnya di bagian ekstraseluler. Domain intraseluler dari Ten-a, Ten-m/Odz dan C. elegans TEN-1 secara signifikan berbeda, baik dalam ukuran dan struktur, dari domain yang setara dari teneurin vertebrata, tetapi domain ekstraseluler dari semua protein ini sangat mirip.
Fungsi
Teneurin bertranslokasi ke nukleus tempat mereka mengatur aktivitas transkripsi. Teneurin meningkatkan pertumbuhan neurit dan adhesi sel. Domain intraseluler berinteraksi dengan represor transkripsional pengikatan DNA dan juga mengatur aktivitas faktor transkripsi.
Selain itu, teneurin telah diketahui berinteraksi dengan protein adaptor sitoskeleton, CAP/ponsin, menunjukkan peran pensinyalan sel dan regulasi organisasi aktin.[3]
Teneurin-3 mengatur struktural dan fungsional sirkuit dari sel ganglion retina dalam sistem visual vertebrata.[4]
Struktur
Ten-m1–4, terdapat sebagai homodimer dan memiliki interaksi homofilik pada vertebrata.
Domain terminal C
Domain ekstraseluler C-terminal yang besar terdiri dari delapan pengulangan seperti EGF (lihat PROSITEDOC ), sebuah wilayah dengan sistein yang dilestarikan dan pengulangan YD yang unik.
N terminal domain
| Wilayah Intraseluler Teneurin | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikasi | |||||||||
| Simbol | Ten_N | ||||||||
| Pfam | PF06484 | ||||||||
| InterPro | IPR009471 | ||||||||
| |||||||||
Domain teneurin intraseluler (IC) (∼300-400 aa) terletak di ujung-N dan berisi sejumlah situs fosforilasi tirosin putatif yang dikonservasi, dua motif pengikat kalsium seperti tangan EF, dan dua domain poliprolin. Peregangan kaya-prolin ini adalah karakteristik dari situs pengikatan SH3. Ada perbedaan besar antara domain intraseluler invertebrata dan teneurin vertebrata serta antara protein invertebrata yang berbeda.[5][6][7][8][9]
Domain ini ditemukan di daerah terminal-N intraseluler dari famili teneurin.
Gen manusia
Protein manusia yang dikodekan protein domain teneurin (TENM1-4) adalah daftar dalam kotak info.
Bacaan lebih lanjut
- Baumgartner S, Martin D, Hagios C, Chiquet-Ehrismann R (August 1994). "Tenm, a Drosophila gene related to tenascin, is a new pair-rule gene". EMBO J. 13 (16): 3728–40. PMC 395283
. PMID 8070401. - Levine A, Bashan-Ahrend A, Budai-Hadrian O, Gartenberg D, Menasherow S, Wides R (May 1994). "Odd Oz: a novel Drosophila pair rule gene". Cell. 77 (4): 587–98. doi:10.1016/0092-8674(94)90220-8. PMID 7514504.
- Tucker RP, Chiquet-Ehrismann R (February 2006). "Teneurins: a conserved family of transmembrane proteins involved in intercellular signaling during development". Dev. Biol. 290 (2): 237–45. doi:10.1016/j.ydbio.2005.11.038. PMID 16406038.
- ^ Drabikowski, Krzysztof; Trzebiatowska, Agnieszka; Chiquet-Ehrismann, Ruth (2005-06-01). "ten-1, an essential gene for germ cell development, epidermal morphogenesis, gonad migration, and neuronal pathfinding in Caenorhabditis elegans". Developmental Biology. 282 (1): 27–38. doi:10.1016/j.ydbio.2005.02.017. ISSN 0012-1606. PMID 15936327.
- ^ "Teneurin-2 is expressed in tissues that regulate limb and somite pattern formation and is induced in vitro and in situ by FGF8". Dev. Dyn. 220 (1): 27–39. January 2001. doi:10.1002/1097-0177(2000)9999:9999<::AID-DVDY1084>3.0.CO;2-B. PMID 11146505.
- ^ "Teneurins: important regulators of neural circuitry". Int J Biochem Cell Biol. 41 (5): 990–3. 2009. doi:10.1016/j.biocel.2008.06.014. PMID 18723111.
- ^ "Teneurin-3 specifies morphological and functional connectivity of retinal ganglion cells in the vertebrate visual system". Cell Rep. 5 (3): 582–92. 2013. doi:10.1016/j.celrep.2013.09.045. PMC 3898612 . PMID 24183672.
- ^ "Teneurin-1, a vertebrate homologue of the Drosophila pair-rule gene ten-m, is a neuronal protein with a novel type of heparin-binding domain". J. Cell Sci. 112 (12): 2019–32. June 1999. PMID 10341219.
- ^ "The intracellular domain of teneurin-2 has a nuclear function and represses zic-1-mediated transcription". J. Cell Sci. 116 (Pt 14): 2957–66. July 2003. doi:10.1242/jcs.00603. PMID 12783990.
- ^ "Teneurins: a conserved family of transmembrane proteins involved in intercellular signaling during development". Dev. Biol. 290 (2): 237–45. February 2006. doi:10.1016/j.ydbio.2005.11.038. PMID 16406038.
- ^ "Teneurins: transmembrane proteins with fundamental roles in development". Int. J. Biochem. Cell Biol. 39 (2): 292–7. 2007. doi:10.1016/j.biocel.2006.09.012. PMID 17095284.
- ^ "Teneurins, a transmembrane protein family involved in cell communication during neuronal development". Cell. Mol. Life Sci. 64 (12): 1452–6. June 2007. doi:10.1007/s00018-007-7108-9. PMID 17502993.