Lompat ke isi

Rhizaria: Perbedaan antara revisi

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Jelajahi riwayat secara interaktif
← Revisi sebelumnyaRevisi selanjutnya →
Konten dihapus Konten ditambahkan
VisualTeks wiki
HsfBot (bicara | kontrib)
Bot
1.172.010 suntingan
k Bot: Penggantian teks otomatis (-Nampak, +Tampak; -nampak, +tampak; -Nampaknya, +Tampaknya; -nampaknya, +tampaknya)
Tomaniaz (bicara | kontrib)
14 suntingan
(7 revisi perantara oleh 5 pengguna tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
{{Infobox spesies
{{automatic taxobox
| fossil_range = [[Neoproterozoikum]] - Sekarang
| image = live_Ammonia_tepida.jpg
| image_width = 200px
| image_caption = ''Ammonia tepida'' ([[Foraminifera]])
| display_parents = 4
| taxon = Rhizaria
| authority = [[Cavalier-Smith]], 2002
| subdivision_ranks = Filum
| subdivision_ranks = Filum
| subdivision =
| subdivision =
Baris 15: Baris 8:
}}
}}


'''Rhizaria''' adalah kelompok besar dari [[protista]] yang kaya akan spesies.<ref name="pmid15148395">{{cite journal |author=Nikolaev SI, Berney C, Fahrni JF, ''et al'' |title=The twilight of Heliozoa and rise of Rhizaria, an emerging supergroup of amoeboid eukaryotes |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volume=101 |issue=21 |pages=8066–71 |year=2004 |month=May |pmid=15148395 |pmc=419558 |doi=10.1073/pnas.0308602101 |url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15148395}}</ref> Bentuk mereka sangat beragam, namun kebanyakan dari mereka berupa [[amoeboid]] (mirip amoeba) dengan mempunyai pseudopodia (kaki semu) filosa, retikulosa, atau ditopang mukrotubulus. Banyak rhizaria yang menghasilkan cangkang atau rangka yang strukturnya bisa cukup kompleks dan rangka atau cangkang ini merupakan mayoritas dari fosil protozoa. hampir semua anggota rhizaria memiliki [[mitokondria]] dengan krista berbentuk tubuler (seperti tabung).
'''Rhizaria''' adalah kelompok besar dari [[protista]] yang kaya akan spesies.<ref name="pmid15148395">{{cite journal |author=Nikolaev SI, Berney C, Fahrni JF, ''et al'' |title=The twilight of Heliozoa and rise of Rhizaria, an emerging supergroup of amoeboid eukaryotes |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |volume=101 |issue=21 |pages=8066–71 |year=2004 |month=May |pmid=15148395 |pmc=419558 |doi=10.1073/pnas.0308602101 |url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15148395}}</ref> Bentuk mereka sangat beragam, tetapi kebanyakan dari mereka berupa [[amoeboid]] (mirip amoeba) dengan mempunyai pseudopodia (kaki semu) filosa, retikulosa, atau ditopang mukrotubulus. Banyak rhizaria yang menghasilkan cangkang atau rangka yang strukturnya bisa cukup kompleks dan rangka atau cangkang ini merupakan mayoritas dari fosil protozoa. hampir semua anggota rhizaria memiliki [[mitokondria]] dengan krista berbentuk tubuler (seperti tabung).


== Kelompok ==
== Kelompok ==
Baris 26: Baris 19:
* [[Radiolaria]] - Amoeboid dengan aksopoda, umumnya sebagai [[plankton]] laut.
* [[Radiolaria]] - Amoeboid dengan aksopoda, umumnya sebagai [[plankton]] laut.


Beberapa kelompok lain mungkin termasuk dalam Cercozoa, namun pada beberapa pohon tampak lebih dekat pada Foraminifera. Kelompok ini adalah [[Phytomyxea]] dan [[Ascetosporea]], masing-masing merupakan parasit tumbuhan dan hewan, dan amoeboid ''[[Gromia]]'' yang ganjil. Kelompok-kelompok rhizaria ini dianggap berkerabat dekat terutama berdasarkan kemiripan genetik, dan dianggap sebagai perluasan dari Cercozoa. Nama Rhizaria untuk kelompok yang diperluas tersebut diperkenalkan oleh [[Thomas Cavalier-Smith]] pada tahun 2002,<ref>{{cite journal
Beberapa kelompok lain mungkin termasuk dalam Cercozoa, tetapi pada beberapa pohon tampak lebih dekat pada Foraminifera. Kelompok ini adalah [[Phytomyxea]] dan [[Ascetosporea]], masing-masing merupakan parasit tumbuhan dan hewan, dan amoeboid ''[[Gromia]]'' yang ganjil. Kelompok-kelompok rhizaria ini dianggap berkerabat dekat terutama berdasarkan kemiripan genetik, dan dianggap sebagai perluasan dari Cercozoa. Nama Rhizaria untuk kelompok yang diperluas tersebut diperkenalkan oleh [[Thomas Cavalier-Smith]] pada tahun 2002,<ref>{{cite journal
| first = Thomas
| first = Thomas
| last = Cavalier-Smith
| last = Cavalier-Smith
Baris 32: Baris 25:
| title = The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa
| title = The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa
| journal = International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
| journal = International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
| year = 2002 | volume = 52 | issue = 2 | pages = 297–354
| year = 2002
| volume = 52
| issue = 2
| pages = 297–354
| issn = 1466-5026
| issn = 1466-5026
| url = http://ijs.sgmjournals.org/cgi/content/abstract/52/2/297
| url = http://ijs.sgmjournals.org/cgi/content/abstract/52/2/297
| accessdate = 2007-06-08
| accessdate = 2007-06-08
| pmid = 11931142
| pmid = 11931142
| archive-date = 2010-12-24
| archive-url = https://web.archive.org/web/20101224182811/http://ijs.sgmjournals.org/cgi/content/abstract/52/2/297
| dead-url = yes
}}</ref> yang juga memasukkan [[centrohelida]] dan [[Apusozoa]].
}}</ref> yang juga memasukkan [[centrohelida]] dan [[Apusozoa]].


Baris 42: Baris 41:
Rhizaria adalah bagian dari klad [[bikonta]], yang juga terdiri dari [[Archaeplastida]], [[Chromalveolata]], [[Excavata]], dan beberapa kelompok yang masih tidak pasti seperti [[Apusozoa]] dan [[Centrohelida]]. Sebagai bikonta, mereka diturunkan dari eukariota [[heterotrof]] yang berflagel dua.
Rhizaria adalah bagian dari klad [[bikonta]], yang juga terdiri dari [[Archaeplastida]], [[Chromalveolata]], [[Excavata]], dan beberapa kelompok yang masih tidak pasti seperti [[Apusozoa]] dan [[Centrohelida]]. Sebagai bikonta, mereka diturunkan dari eukariota [[heterotrof]] yang berflagel dua.


Dahulu, banyak rhizaria dianggap sebagai [[hewan]] karena daya gerak dan keheterotrofannya sebagai dasar. Namun saat sistem lima kingdom mengambil alih dikotomi hewan-tumbuhan , rhizaria ditempatkan pada kingdom [[Protista]]. Lalu, setelah [[Carl Woese]] mempublikasikan sistem tiga domainnya, karena kingdom [[monera]] bersifat parafiletik, para taksonom mengalihkan perhatian mereka pada domain eukariota, dan sifat parafiletik dari [[Protista]]. Setelah banyak perdebatan yang berlanjut hingga sekarang, Rhizaria muncul sebagai kelompok yang monofiletik.<ref>{{cite journal
Dahulu, banyak rhizaria dianggap sebagai [[hewan]] karena daya gerak dan keheterotrofannya sebagai dasar. Namun saat sistem lima kingdom mengambil alih dikotomi hewan-tumbuhan, rhizaria ditempatkan pada kingdom [[Protista]]. Lalu, setelah [[Carl Woese]] mempublikasikan sistem tiga domainnya, karena kingdom [[monera]] bersifat parafiletik, para taksonom mengalihkan perhatian mereka pada domain eukariota, dan sifat parafiletik dari [[Protista]]. Setelah banyak perdebatan yang berlanjut hingga sekarang, Rhizaria muncul sebagai kelompok yang monofiletik.<ref>{{cite journal
| first = Burki
| first = Burki
| last = Fabien
| last = Fabien
Baris 53: Baris 52:
| doi = 10.1371/journal.pone.0000790
| doi = 10.1371/journal.pone.0000790
}}</ref>
}}</ref>

=== Filogeni ===
Rhizaria adalah sebuah [[Klad|kelompok monofiletik]] yang terdiri dari dua filum saudari: [[Cercozoa]] dan [[Retaria]]. Secara berurutan, Cercozoa dan Retaria juga bersifat [[monofiletik]].<ref name="pmid18952499">{{cite journal|last1=Bass|first1=D.|last2=Chao|first2=E.E.|last3=Nikolaev|first3=S.|display-authors=etal|date=Februari 2009|title=Phylogeny of Novel Naked Filose and Reticulose Cercozoa: Granofilosea cl. n. and Proteomyxidea Revised|journal=Protist|volume=160|issue=1|pages=75–109|doi=10.1016/j.protis.2008.07.002|pmid=18952499}}</ref><ref name="Howe">>{{cite journal|last=Howe|first=Alexis T.|last2=Bass|first2=David|last3=Scoble|first3=Josephine M.|last4=Lewis|first4=Rhodri|last5=Vickerman|first5=Keith|last6=Arndt|first6=Hartmut|last7=Cavalier-Smith|first7=Thomas|author7-link=Thomas Cavalier-Smith|display-authors=3|date=2011|title=Novel Cultured Protists Identify Deep-branching Environmental DNA Clades of Cercozoa: New Genera Tremula, Micrometopion, Minimassisteria, Nudifila, Peregrinia|journal=Protist|volume=162|issue=2|pages=332–372|doi=10.1016/j.protis.2010.10.002|pmid=21295519}}</ref> Berikut adalah kladogram yang menggambarkan hubungan evolusioner antara semua [[Kelas (biologi)|kelas]] rhizaria, dan dibuat berdasarkan karya-karya dari [[Cavalier-Smith]] ''dkk.'' (2018),<ref name="RhizariaPhylo2018">{{cite journal|last1=Cavalier-Smith|first1=Thomas|last2=Chao|first2=Ema E .|last3=Lewis|first3=Rhodri|date=April 2018|title=Multigene phylogeny and cell evolution of chromist infrakingdom Rhizaria: contrasting cell organisation of sister phyla Cercozoa and Retaria|journal=Protoplasma|volume=255|issue=5|pages=1517–1574|doi=10.1007/s00709-018-1241-1|pmc=6133090|pmid=29666938|author1-link=Thomas Cavalier-Smith}}</ref> dan Irwin ''dkk.'' (2019).<ref name="MonoCercozoa">{{Cite journal|last1=Irwin|first1=Nicholas A. T.|last2=Tikhonenkov|first2=Denis V.|last3=Hehenberger|first3=Elisabeth|last4=Mylnikov|first4=Alexander P.|last5=Burki|first5=Fabien|last6=Keeling|first6=Patrick J.|display-authors=3|date=2019-01-01|title=Phylogenomics supports the monophyly of the Cercozoa|journal=Molecular Phylogenetics and Evolution|volume=130|pages=416–423|doi=10.1016/j.ympev.2018.09.004|issn=1055-7903|pmid=30318266|s2cid=52982396}}</ref>
{{clade|{{clade|style=font-size:100%;line-height:80%
|label1='''Rhizaria'''
|1={{clade
|label2=[[Retaria]]
|2={{clade
|1={{clade
|2=[[Polycystinea]] [[File:Radiolarian.png|50px]]
|1=[[Foraminifera]] [[File:Foraminifères de Ngapali.jpg|50px]]
}}
|2={{clade
|1=[[Acantharea]] [[File:Acantharia confocial micrograph 2.png|50px]]
|2=[[Sticholonchea]] [[File:Sticholonche.png|50px]]
}}
}}
|label1=[[Cercozoa]]
|1={{clade
|label1=[[Filosa]]
|1={{clade
|label2=[[Reticulofilosa]]
|2={{clade
|1=[[Granofilosea]] [[File:Clathrulina elegans - Iconographia Zoologica (cropped).tif|35px]]
|2=[[Chlorarachnea]] [[File:Chlorarachnion reptans.jpg|50px]]
}}
|label1=[[Monadofilosa]]
|1={{clade
|2=[[Metromonadea]] [[File:Metromonas.jpg|50px]]
|1={{clade
|2=[[Helkesea]]
|1={{clade
|2=[[Sarcomonadea]] (paraphyletic) [[File:Cercomonas sp.jpg|50px]]
|1={{clade
|2=[[Thecofilosea]] [[File:Haeckel Phaeodaria 1.jpg|40px]]
|1=[[Imbricatea]] [[File:Euglypha sp.jpg|50px]]
}}
}}
}}
}}
}}
|2={{clade
|label1=[[Endomyxa]]
|1={{clade
|1=[[Phytomyxea]] [[File:Vampyrella lateritia.jpg|50px]]
|2=[[Gromiidea]] [[File:Die Gartenlaube (1890) b 083.jpg|50px]]
}}
|2=''[[Lapot gusevi]]''
}}
}}
}}
|label2=[[Halvaria]]
|2={{clade
|1=[[Stramenopile]]s [[File:Cafeteria roenbergensis atcc50561 Protsville (cropped).jpg|50px]]
|2=[[Alveolata]] [[File:Ceratium furca.jpg|90px]]
}}
}}|label1=[[SAR Supergroup]]}}


== Rujukan ==
== Rujukan ==
Baris 59: Baris 115:
== Pranala luar ==
== Pranala luar ==


* [http://www.unige.ch/sciences/biologie/biani/msg/Amoeboids/Rizharia.html Molecular Phylogeny of Amoeboid Protists - Tree of Rhizaria]
* [http://www.unige.ch/sciences/biologie/biani/msg/Amoeboids/Rizharia.html Molecular Phylogeny of Amoeboid Protists - Tree of Rhizaria] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20050912074718/http://www.unige.ch/sciences/biologie/biani/msg/Amoeboids/Rizharia.html |date=2005-09-12 }}


{{Eukaryota}}
{{Eukaryota}}
{{Rhizaria}}
{{Rhizaria}}
{{Taxonbar|from=Q855740}}


⚫
[[Kategori:Rhizaria| ]]
[[Kategori:Eukariota]]
[[Kategori:Eukariota]]
[[Kategori:Protista]]
[[Kategori:Protista]]
⚫
[[Kategori:Rhizaria|*]]

Revisi per 7 Juni 2024 04.03

Rhizaria Edit nilai pada Wikidata
Taksonomi
SuperkerajaanEukaryota
InfrakerajaanRhizaria Edit nilai pada Wikidata
Cavalier-Smith, 1987
Filum
Cercozoa

Retaria

Foraminifera
Radiolaria

Rhizaria adalah kelompok besar dari protista yang kaya akan spesies.[1] Bentuk mereka sangat beragam, tetapi kebanyakan dari mereka berupa amoeboid (mirip amoeba) dengan mempunyai pseudopodia (kaki semu) filosa, retikulosa, atau ditopang mukrotubulus. Banyak rhizaria yang menghasilkan cangkang atau rangka yang strukturnya bisa cukup kompleks dan rangka atau cangkang ini merupakan mayoritas dari fosil protozoa. hampir semua anggota rhizaria memiliki mitokondria dengan krista berbentuk tubuler (seperti tabung).

Kelompok

Ada tiga kelompok utama rhizaria:[2]

  • Cercozoa - Bermacam rhizaria berflagel dan rhizaria yang mirip amoeba, biasanya berpseudopodia berbentuk filosa, umum ditemukan di tanah.

Beberapa kelompok lain mungkin termasuk dalam Cercozoa, tetapi pada beberapa pohon tampak lebih dekat pada Foraminifera. Kelompok ini adalah Phytomyxea dan Ascetosporea, masing-masing merupakan parasit tumbuhan dan hewan, dan amoeboid Gromia yang ganjil. Kelompok-kelompok rhizaria ini dianggap berkerabat dekat terutama berdasarkan kemiripan genetik, dan dianggap sebagai perluasan dari Cercozoa. Nama Rhizaria untuk kelompok yang diperluas tersebut diperkenalkan oleh Thomas Cavalier-Smith pada tahun 2002,[3] yang juga memasukkan centrohelida dan Apusozoa.

Kekerabatan evolusioner

Rhizaria adalah bagian dari klad bikonta, yang juga terdiri dari Archaeplastida, Chromalveolata, Excavata, dan beberapa kelompok yang masih tidak pasti seperti Apusozoa dan Centrohelida. Sebagai bikonta, mereka diturunkan dari eukariota heterotrof yang berflagel dua.

Dahulu, banyak rhizaria dianggap sebagai hewan karena daya gerak dan keheterotrofannya sebagai dasar. Namun saat sistem lima kingdom mengambil alih dikotomi hewan-tumbuhan, rhizaria ditempatkan pada kingdom Protista. Lalu, setelah Carl Woese mempublikasikan sistem tiga domainnya, karena kingdom monera bersifat parafiletik, para taksonom mengalihkan perhatian mereka pada domain eukariota, dan sifat parafiletik dari Protista. Setelah banyak perdebatan yang berlanjut hingga sekarang, Rhizaria muncul sebagai kelompok yang monofiletik.[4]

Filogeni

Rhizaria adalah sebuah kelompok monofiletik yang terdiri dari dua filum saudari: Cercozoa dan Retaria. Secara berurutan, Cercozoa dan Retaria juga bersifat monofiletik.[5][6] Berikut adalah kladogram yang menggambarkan hubungan evolusioner antara semua kelas rhizaria, dan dibuat berdasarkan karya-karya dari Cavalier-Smith dkk. (2018),[7] dan Irwin dkk. (2019).[8]

SAR Supergroup
Rhizaria
Cercozoa
Filosa
Monadofilosa
 
 
 
 

Imbricatea

 
 

Thecofilosea

 
 
 

Sarcomonadea (paraphyletic)

 
 
 

Helkesea

 
 
 

Metromonadea

 
 
Reticulofilosa
 

Granofilosea

 
 

Chlorarachnea

 
 
 
 
Endomyxa
 

Phytomyxea

 
 

Gromiidea

 
 
 

Lapot gusevi

 
 
 
Retaria
 
 

Foraminifera

 
 

Polycystinea

 
 
 
 

Acantharea

 
 

Sticholonchea

 
 
 
 
Halvaria
 

Stramenopiles

 
 

Alveolata

 
 
 

Rujukan

  1. ^ Nikolaev SI, Berney C, Fahrni JF; et al. (2004). "The twilight of Heliozoa and rise of Rhizaria, an emerging supergroup of amoeboid eukaryotes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (21): 8066–71. doi:10.1073/pnas.0308602101. PMC 419558 alt=Dapat diakses gratis. PMID 15148395. 
  2. ^ Moreira D, von der Heyden S, Bass D, López-García P, Chao E, Cavalier-Smith T (2007). "Global eukaryote phylogeny: Combined small- and large-subunit ribosomal DNA trees support monophyly of Rhizaria, Retaria and Excavata". Mol. Phylogenet. Evol. 44 (1): 255–66. doi:10.1016/j.ympev.2006.11.001. PMID 17174576. 
  3. ^ Cavalier-Smith, Thomas (2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (2): 297–354. ISSN 1466-5026. PMID 11931142. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2010-12-24. Diakses tanggal 2007-06-08. 
  4. ^ Fabien, Burki (2007). "Phylogenomics Reshuffles the Eukaryotic Supergroups". PLoS ONE. 2 (8): e790–. doi:10.1371/journal.pone.0000790. Diakses tanggal 2008-01-24. 
  5. ^ Bass, D.; Chao, E.E.; Nikolaev, S.; et al. (Februari 2009). "Phylogeny of Novel Naked Filose and Reticulose Cercozoa: Granofilosea cl. n. and Proteomyxidea Revised". Protist. 160 (1): 75–109. doi:10.1016/j.protis.2008.07.002. PMID 18952499. 
  6. ^ >Howe, Alexis T.; Bass, David; Scoble, Josephine M.; et al. (2011). "Novel Cultured Protists Identify Deep-branching Environmental DNA Clades of Cercozoa: New Genera Tremula, Micrometopion, Minimassisteria, Nudifila, Peregrinia". Protist. 162 (2): 332–372. doi:10.1016/j.protis.2010.10.002. PMID 21295519. 
  7. ^ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E .; Lewis, Rhodri (April 2018). "Multigene phylogeny and cell evolution of chromist infrakingdom Rhizaria: contrasting cell organisation of sister phyla Cercozoa and Retaria". Protoplasma. 255 (5): 1517–1574. doi:10.1007/s00709-018-1241-1. PMC 6133090 alt=Dapat diakses gratis. PMID 29666938. 
  8. ^ Irwin, Nicholas A. T.; Tikhonenkov, Denis V.; Hehenberger, Elisabeth; et al. (2019-01-01). "Phylogenomics supports the monophyly of the Cercozoa". Molecular Phylogenetics and Evolution. 130: 416–423. doi:10.1016/j.ympev.2018.09.004. ISSN 1055-7903. PMID 30318266. 

Pranala luar

Diperoleh dari "https://wiki-indonesia.club/w/index.php?title=Rhizaria&oldid=25803509"