Metanol dehidrogenase: Perbedaan antara revisi
Tidak ada ringkasan suntingan |
k Bot: Perubahan kosmetika |
||
(6 revisi perantara oleh 4 pengguna tidak ditampilkan) | |||
Baris 1: | Baris 1: | ||
[[Berkas:PDB 1lrw EBI.jpg| |
[[Berkas:PDB 1lrw EBI.jpg|jmpl|ka|200px|Subunit alpha enzim metanol dehidrogenase.]] |
||
'''Metanol dehidrogenase''' (MDH, EC 1.1.99.8) merupakan suatu [[protein]] quinon yang berperan dalam [[metabolisme]] senyawa ber[[karbon]] tunggal.<ref name=liu>Liu Q, Kirchhoff JR, Faehnle CR, Viola RE, Hudson RA. 2005. A rapid method for the purification of methanol dehydrogenase from ''Methylobacterium extorquens''. ''Prot Exp and Pur'' 46:316-320.</ref> Dengan adanya enzim ini, senyawa berkarbon tunggal akan diubah menjadi senyawa [[formaldehida]] yang masuk ke dalam siklus [[metabolisme]] lanjutan.<ref name=chris>Christoserdova L, Laukel M, Portais JC, Vorholt JA, Lindstorm ME. 2004. Multiple formate dehydrogenase enzymes in the facultative methylotroph ''Methylobacterium extorquens'' AM1 are dispensable for growth on methanol. ''J Bacteriol'' 186:22-28.</ref> Proses inilah yang menjadi kunci dari produksi energi bagi pertumbuhan dan perkembangan [[bakteri]] [[metilotrof]].<ref name=anthony1986>Anthony C. 1986. Bacterial oxidation of methane and methanol. ''Adv Microb Physiol'' 27:113-120.</ref> Pada bakteri fakultatif metilotrof, konsentrasi enzim metanol dehidrogenase di dalam [[sel]]nya dapat mencapai 10-15%.<ref name=machlin>Machlin SM, Hanson R. 1988. Nucleotide sequence and transcriptional start site of the ''Methylobacterium organophilum'' XX methanol dehydrogenase structural gene. ''J Bacteriol'' 170(10):4739-4747.</ref> Konsentrasi enzim ini pun meningkat dengan adanya penambahan senyawa [[metilamina]] sebagai sumber karbon tambahannya.<ref name=machlin/> Pengukuran konsentrasi enzim (total protein) dapat menggunakan metode [[Bradford]].<ref name=Bradford>Bradford MM. 1976. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein–dye binding. ''Anal Biochem'' 72:248–254.</ref> |
'''Metanol dehidrogenase''' (MDH, EC 1.1.99.8) merupakan suatu [[protein]] quinon yang berperan dalam [[metabolisme]] senyawa ber[[karbon]] tunggal.<ref name=liu>Liu Q, Kirchhoff JR, Faehnle CR, Viola RE, Hudson RA. 2005. A rapid method for the purification of methanol dehydrogenase from ''Methylobacterium extorquens''. ''Prot Exp and Pur'' 46:316-320.</ref> Dengan adanya enzim ini, senyawa berkarbon tunggal akan diubah menjadi senyawa [[formaldehida]] yang masuk ke dalam siklus [[metabolisme]] lanjutan.<ref name=chris>Christoserdova L, Laukel M, Portais JC, Vorholt JA, Lindstorm ME. 2004. Multiple formate dehydrogenase enzymes in the facultative methylotroph ''Methylobacterium extorquens'' AM1 are dispensable for growth on methanol. ''J Bacteriol'' 186:22-28.</ref> Proses inilah yang menjadi kunci dari produksi [[energi]] bagi pertumbuhan dan [[perkembangan]] [[bakteri]] [[metilotrof]].<ref name=anthony1986>Anthony C. 1986. Bacterial oxidation of methane and methanol. ''Adv Microb Physiol'' 27:113-120.</ref> Pada bakteri fakultatif metilotrof, konsentrasi enzim metanol dehidrogenase di dalam [[sel]]nya dapat mencapai 10-15%.<ref name=machlin>Machlin SM, Hanson R. 1988. Nucleotide sequence and transcriptional start site of the ''Methylobacterium organophilum'' XX methanol dehydrogenase structural gene. ''J Bacteriol'' 170(10):4739-4747.</ref> Konsentrasi enzim ini pun meningkat dengan adanya penambahan senyawa [[metilamina]] sebagai sumber karbon tambahannya.<ref name=machlin/> Pengukuran konsentrasi enzim (total protein) dapat menggunakan metode [[Bradford]].<ref name=Bradford>Bradford MM. 1976. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein–dye binding. ''Anal Biochem'' 72:248–254.</ref> |
||
⚫ | Enzim metanol dehidrogenase memiliki struktur α2β2 tetramer, di mana subunit α memiliki ukuran 66 kDa, sedangkan subunit β hanya 8,5 kDa.<ref name=anthony2003>Anthony C, Williams P. 2003. The structure and mechanism of methanol dehydrogenase. ''Biochim Biophys Acta'' 1647:18–23.</ref> Di dalam setiap subunit α terdapat [[molekul]] [[koenzim]] yang terikat secara nonkovalen.<ref name=liu/> Molekul ini dikenal dengan istilah [[pyrroloquinoline quinone]] (PQQ, 4,5-dihydro-4,5-dioxo-1H-pyrrolo[2,3-f]quinoline-2,7,9-tricarboxylic acid).<ref name=liu/> Di samping itu juga terdapat ion kalsium ( |
||
⚫ | Enzim metanol dehidrogenase memiliki struktur α2β2 tetramer, di mana subunit α memiliki ukuran 66 kDa, sedangkan subunit β hanya 8,5 kDa.<ref name=anthony2003>Anthony C, Williams P. 2003. The structure and mechanism of methanol dehydrogenase. ''Biochim Biophys Acta'' 1647:18–23.</ref> Di dalam setiap subunit α terdapat [[molekul]] [[koenzim]] yang terikat secara nonkovalen.<ref name=liu/> Molekul ini dikenal dengan istilah [[pyrroloquinoline quinone]] (PQQ, 4,5-dihydro-4,5-dioxo-1H-pyrrolo[2,3-f]quinoline-2,7,9-tricarboxylic acid).<ref name=liu/> Di samping itu juga terdapat ion [[kalsium]] (Ca<sup>2+</sup>) yang berperan sebagai [[kofaktor]] bagi enzim ini.<ref name=liu/> Senyawa PQQ dan ion kalsium ini terletak pada sisi aktif enzim dan berperan penting dalam mengaktivasi kerja enzim.<ref name=liu/> Untuk memproduksi enzim metanol dehidrogenase setidaknya dibutuhkan 26 [[gen]] yang terlibat, di antaranya terdapat gen yang mengkodekan struktur [[polipeptida]], [[sitokrom]] cL, dan gen untuk mensintesis senyawa PQQ.<ref name=davag>Davagnino J, Springer AL, Lidstorm ME. 1998. An RNA polymerase preparation from Methylobacterium extorquens AM1 capable of transcribing from a methylotrophic promoter. Microbiol 44:177-182.</ref> |
||
== Referensi == |
== Referensi == |
||
{{Reflist}} |
{{Reflist}} |
||
{{Enzim}} |
{{Enzim}} |
||
{{biokimia-stub}} |
|||
[[Kategori:Artikel kelas-B bertopik biologi]] |
|||
[[Kategori:Enzim]] |
[[Kategori:Enzim]] |
||
[[en:methanol dehydrogenase]] |
|||
[[es:Metanol deshidrogenasa]] |
|||
[[it:Metanolo deidrogenasi]] |
|||
[[ja:メタノールデヒドロゲナーゼ]] |
Revisi terkini sejak 28 November 2017 17.51
Metanol dehidrogenase (MDH, EC 1.1.99.8) merupakan suatu protein quinon yang berperan dalam metabolisme senyawa berkarbon tunggal.[1] Dengan adanya enzim ini, senyawa berkarbon tunggal akan diubah menjadi senyawa formaldehida yang masuk ke dalam siklus metabolisme lanjutan.[2] Proses inilah yang menjadi kunci dari produksi energi bagi pertumbuhan dan perkembangan bakteri metilotrof.[3] Pada bakteri fakultatif metilotrof, konsentrasi enzim metanol dehidrogenase di dalam selnya dapat mencapai 10-15%.[4] Konsentrasi enzim ini pun meningkat dengan adanya penambahan senyawa metilamina sebagai sumber karbon tambahannya.[4] Pengukuran konsentrasi enzim (total protein) dapat menggunakan metode Bradford.[5]
Enzim metanol dehidrogenase memiliki struktur α2β2 tetramer, di mana subunit α memiliki ukuran 66 kDa, sedangkan subunit β hanya 8,5 kDa.[6] Di dalam setiap subunit α terdapat molekul koenzim yang terikat secara nonkovalen.[1] Molekul ini dikenal dengan istilah pyrroloquinoline quinone (PQQ, 4,5-dihydro-4,5-dioxo-1H-pyrrolo[2,3-f]quinoline-2,7,9-tricarboxylic acid).[1] Di samping itu juga terdapat ion kalsium (Ca2+) yang berperan sebagai kofaktor bagi enzim ini.[1] Senyawa PQQ dan ion kalsium ini terletak pada sisi aktif enzim dan berperan penting dalam mengaktivasi kerja enzim.[1] Untuk memproduksi enzim metanol dehidrogenase setidaknya dibutuhkan 26 gen yang terlibat, di antaranya terdapat gen yang mengkodekan struktur polipeptida, sitokrom cL, dan gen untuk mensintesis senyawa PQQ.[7]
Referensi
[sunting | sunting sumber]- ^ a b c d e Liu Q, Kirchhoff JR, Faehnle CR, Viola RE, Hudson RA. 2005. A rapid method for the purification of methanol dehydrogenase from Methylobacterium extorquens. Prot Exp and Pur 46:316-320.
- ^ Christoserdova L, Laukel M, Portais JC, Vorholt JA, Lindstorm ME. 2004. Multiple formate dehydrogenase enzymes in the facultative methylotroph Methylobacterium extorquens AM1 are dispensable for growth on methanol. J Bacteriol 186:22-28.
- ^ Anthony C. 1986. Bacterial oxidation of methane and methanol. Adv Microb Physiol 27:113-120.
- ^ a b Machlin SM, Hanson R. 1988. Nucleotide sequence and transcriptional start site of the Methylobacterium organophilum XX methanol dehydrogenase structural gene. J Bacteriol 170(10):4739-4747.
- ^ Bradford MM. 1976. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein–dye binding. Anal Biochem 72:248–254.
- ^ Anthony C, Williams P. 2003. The structure and mechanism of methanol dehydrogenase. Biochim Biophys Acta 1647:18–23.
- ^ Davagnino J, Springer AL, Lidstorm ME. 1998. An RNA polymerase preparation from Methylobacterium extorquens AM1 capable of transcribing from a methylotrophic promoter. Microbiol 44:177-182.