Lompat ke isi

Alveolata: Perbedaan antara revisi

Dari Wikipedia bahasa Indonesia, ensiklopedia bebas
Konten dihapus Konten ditambahkan
Wagino Bot (bicara | kontrib)
k →‎Pranala luar: Bot: Merapikan artikel
Tomaniaz (bicara | kontrib)
Tidak ada ringkasan suntingan
Tag: kemungkinan perlu pemeriksaan terjemahan VisualEditor-alih
Baris 24: Baris 24:
[[Chromerida]]
[[Chromerida]]
}}
}}
'''Alveolata''' adalah sebuah kelompok [[protista]], dianggap sebagai [[klad]] utama<ref name="Adl2012">{{cite journal | last1 = Adl | first1 = S.M. | display-authors = etal | year = 2012 | title = The revised classification of eukaryotes | journal = Journal of Eukaryotic Microbiology | volume = 59 | issue = 5| pages = 429–514 | doi=10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x | pmid=23020233 | pmc=3483872}}</ref> dan [[superfilum]]<ref name=Ruggiero15>{{cite journal |vauthors=Ruggiero MA, Gordon DP, Orrell TM, Bailly N, Bourgoin T, Brusca RC, Cavalier-Smith T, Guiry MD, Kirk PM |title=A higher level classification of all living organisms |journal=PLOS ONE |volume=10 |issue=4 |pages=e0119248 |year=2015 |pmid=25923521 |pmc=4418965 |doi=10.1371/journal.pone.0119248 |bibcode=2015PLoSO..1019248R |doi-access=free }}</ref> dalam [[Eukarya]]. Mereka saat ini dikelompokkan bersama [[stramenopile]] dan [[Rhizaria]] di antara protista dengan mitokondria tubulokristat ke dalam [[supergrup SAR]].
'''Alveolata''' adalah salah satu superfilum [[protista]].
== Karakteristik ==

Karakteristik yang paling mencolok yang dibagikan adalah keberadaan [[Alveolum kortikal|alveoli kortikal (dekat permukaan)]]. Ini adalah vesikel (kantong) pipih yang disusun sebagai lapisan tepat di bawah [[membran sel]] dan mendukungnya, biasanya berkontribusi pada pelikel yang fleksibel (kulit tipis). Pada [[dinoflagellata]] bersarung, mereka mungkin mengandung pelat kaku. Alveolata memiliki [[mitokondria]] dengan krisa tabung ([[invaginasi]]), dan sel sering memiliki intrusi berbentuk pori melalui permukaan sel. Grup ini berisi organisme yang hidup bebas dan [[parasit]], flagelata predator, dan organisme [[fotosintesis]].
Terdapat tiga filum alveolata:
[[Berkas:EM_alveoli_ciliate_paramecium_putrinum.jpg|pus|jmpl|600x600px|Mikrograf elektron transmisi dari irisan tipis permukaan ciliate ''[[Paramecium]] putrinum'', menunjukkan alveoli (panah merah) di bawah permukaan sel]]
* [[Chromerida]]
Hampir semua genom mitokondria yang disekuensing dari ciliata dan apikompleksa adalah linear.<ref name="Barth2011">{{Cite journal|last1=Barth|first1=D|last2=Berendonk|first2=TU|year=2011|title=Sekuen genom mitokondria dari ciliate ''Paramecium caudatum'' mengungkap pergeseran dalam komposisi nukleotida dan penggunaan kodon dalam genus ''Paramecium''|journal=BMC Genomics|volume=12|page=272|doi=10.1186/1471-2164-12-272|pmc=3118789|pmid=21627782|doi-access=free}}</ref> Mitokondria hampir semuanya membawa [[mtDNA]] mereka sendiri tetapi dengan ukuran genom yang sangat berkurang. Pengecualian adalah ''[[Cryptosporidium]]'' yang hanya tersisa dengan [[mitosom]], genom mitokondria melingkar dari ''[[Acavomonas]]'' dan ''[[Babesia microti]]'',<ref name="Obornik-Lukes-2015">{{Cite journal|last1=Oborník|first1=Miroslav|last2=Lukeš|first2=Julius|date=2015-10-15|title=Genom Organellar dari Chromera dan Vitrella, Kerabat Fototrof Parasit Apikompleksa|url=https://www.annualreviews.org/content/journals/10.1146/annurev-micro-091014-104449|journal=Annual Review of Microbiology|volume=69|pages=129–144|doi=10.1146/annurev-micro-091014-104449|issn=0066-4227|pmid=26092225|access-date=2024-04-15}}</ref><ref name="Cornillot2012">{{Cite journal|year=2012|title=Sekuensing genom Apikompleksa terkecil dari patogen manusia ''Babesia microti''|journal=Nucleic Acids Res.|volume=40|issue=18|pages=9102–14|doi=10.1093/nar/gks700|pmc=3467087|pmid=22833609|vauthors=Cornillot E, Hadj-Kaddour K, Dassouli A, Noel B, Ranwez V, Vacherie B, Augagneur Y, Brès V, Duclos A, Randazzo S, Carcy B, Debierre-Grockiego F, Delbecq S, Moubri-Ménage K, Shams-Eldin H, Usmani-Brown S, Bringaud F, Wincker P, Vivarès CP, Schwarz RT, Schetters TP, Krause PJ, Gorenflot A, Berry V, Barbe V, Ben Mamoun C}}</ref> dan genom mitokondria yang sangat terfragmentasi milik ''[[Toxoplasma]]'', terdiri dari 21 blok sekuens yang rekombinasi untuk menghasilkan segmen yang lebih panjang.<ref>{{Cite journal|last1=Namasivayam|first1=Sivaranjani|last2=Baptista|first2=Rodrigo P.|last3=Xiao|first3=Wenyuan|last4=Hall|first4=Erica M.|last5=Doggett|first5=Joseph S.|last6=Troell|first6=Karin|last7=Kissinger|first7=Jessica C.|date=Mei 2021|title=Genom mitokondria terfragmentasi baru dalam patogen protista Toxoplasma gondii dan koksidia jaringan terkait|journal=Genome Research|volume=31|issue=5|pages=852–865|doi=10.1101/gr.266403.120|pmc=8092004|pmid=33906963}}</ref><ref>{{Cite journal|last1=Namasivayam|first1=Sivaranjani|last2=Sun|first2=Cheng|last3=Bah|first3=Assiatu B.|last4=Oberstaller|first4=Jenna|last5=Pierre-Louis|first5=Edwin|last6=Etheridge|first6=Ronald Drew|last7=Feschotte|first7=Cedric|last8=Pritham|first8=Ellen J.|last9=Kissinger|first9=Jessica C.|date=7 November 2023|title=Invasi besar-besaran DNA organellar mendorong evolusi genom nukleus di Toxoplasma|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences|volume=120|issue=45|pages=–2308569120|bibcode=2023PNAS..12008569N|doi=10.1073/pnas.2308569120|pmc=10636329|pmid=37917792}}</ref>
* [[Ciliata]]
==Sejarah==
* [[Apicomplexa]]
Hubungan antara apikompleksa, dinoflagellata, dan silia telah disarankan selama tahun 1980-an, dan hal ini dikonfirmasi pada awal tahun 1990-an melalui perbandingan urutan RNA ribosomal, terutama oleh Gajadhar ''et al''.<ref>
* [[Dinoflagellata]]
{{cite journal | author = Gajadhar, A. A.

| title = Urutan RNA ribosomal dari ''Sarcocystis muris'', ''Theilera annulata'', dan ''Crypthecodinium cohnii'' mengungkap hubungan evolusioner di antara apikompleksa, dinoflagellata, dan silia
| journal = Parasitologi Molekuler dan Biokimia
| year = 1991 | volume = 45 | issue = 1
| pages = 147–153 | doi = 10.1016/0166-6851(91)90036-6
| pmid = 1904987
|display-authors=etal}}.
</ref> [[Thomas Cavalier-Smith|Cavalier-Smith]] memperkenalkan nama formal Alveolata pada tahun 1991,<ref name="Cavalier-Smith, T. 1991 pp. 113-131">{{cite book |last=Cavalier-Smith |first=T. |chapter=Diversifikasi sel dalam flagelat heterotrof |pages=113–131 |editor-first=David J. |editor-last=Patterson |editor2-first=Jacob |editor2-last=Larsen |editor3=Systematics Association |title=Biologi flagelat heterotrof bebas |chapter-url=https://books.google.com/books?id=-JUWAQAAIAAJ |year=1991 |publisher=Oxford University Press |isbn=978-0-19-857747-8}}</ref> meskipun pada saat itu dia menganggap pengelompokan tersebut sebagai himpunan [[parafilik]]. Banyak biolog lebih memilih menggunakan nama sehari-hari 'alveolata'.<ref>Kumar, S. & Rzhetsky, A. 1996. Hubungan evolusioner kerajaan eukariotik. Jurnal Evolusi Molekuler, 42: 183–193</ref>
== Referensi ==
== Referensi ==
{{reflist}}
{{reflist}}

Revisi per 7 Juni 2024 03.57

Alveolata
Rentang fosil: Ediacaran[1] - Recent
Ceratium furca
Klasifikasi ilmiah
Domain:
(tanpa takson):
Superfilum:
Alveolata
Filum

Ciliophora
Apicomplexa
Dinoflagellata Chromerida

Alveolata adalah sebuah kelompok protista, dianggap sebagai klad utama[2] dan superfilum[3] dalam Eukarya. Mereka saat ini dikelompokkan bersama stramenopile dan Rhizaria di antara protista dengan mitokondria tubulokristat ke dalam supergrup SAR.

Karakteristik

Karakteristik yang paling mencolok yang dibagikan adalah keberadaan alveoli kortikal (dekat permukaan). Ini adalah vesikel (kantong) pipih yang disusun sebagai lapisan tepat di bawah membran sel dan mendukungnya, biasanya berkontribusi pada pelikel yang fleksibel (kulit tipis). Pada dinoflagellata bersarung, mereka mungkin mengandung pelat kaku. Alveolata memiliki mitokondria dengan krisa tabung (invaginasi), dan sel sering memiliki intrusi berbentuk pori melalui permukaan sel. Grup ini berisi organisme yang hidup bebas dan parasit, flagelata predator, dan organisme fotosintesis.

Mikrograf elektron transmisi dari irisan tipis permukaan ciliate Paramecium putrinum, menunjukkan alveoli (panah merah) di bawah permukaan sel

Hampir semua genom mitokondria yang disekuensing dari ciliata dan apikompleksa adalah linear.[4] Mitokondria hampir semuanya membawa mtDNA mereka sendiri tetapi dengan ukuran genom yang sangat berkurang. Pengecualian adalah Cryptosporidium yang hanya tersisa dengan mitosom, genom mitokondria melingkar dari Acavomonas dan Babesia microti,[5][6] dan genom mitokondria yang sangat terfragmentasi milik Toxoplasma, terdiri dari 21 blok sekuens yang rekombinasi untuk menghasilkan segmen yang lebih panjang.[7][8]

Sejarah

Hubungan antara apikompleksa, dinoflagellata, dan silia telah disarankan selama tahun 1980-an, dan hal ini dikonfirmasi pada awal tahun 1990-an melalui perbandingan urutan RNA ribosomal, terutama oleh Gajadhar et al.[9] Cavalier-Smith memperkenalkan nama formal Alveolata pada tahun 1991,[10] meskipun pada saat itu dia menganggap pengelompokan tersebut sebagai himpunan parafilik. Banyak biolog lebih memilih menggunakan nama sehari-hari 'alveolata'.[11]

Referensi

  1. ^ Li, C.-W. (2007). "Ciliated protozoans from the Precambrian Doushantuo Formation, Wengan, South China". Geological Society, London, Special Publications. 286: 151–156. doi:10.1144/SP286.11. 
  2. ^ Adl, S.M.; et al. (2012). "The revised classification of eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429–514. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872alt=Dapat diakses gratis. PMID 23020233. 
  3. ^ Ruggiero MA, Gordon DP, Orrell TM, Bailly N, Bourgoin T, Brusca RC, Cavalier-Smith T, Guiry MD, Kirk PM (2015). "A higher level classification of all living organisms". PLOS ONE. 10 (4): e0119248. Bibcode:2015PLoSO..1019248R. doi:10.1371/journal.pone.0119248alt=Dapat diakses gratis. PMC 4418965alt=Dapat diakses gratis. PMID 25923521. 
  4. ^ Barth, D; Berendonk, TU (2011). "Sekuen genom mitokondria dari ciliate Paramecium caudatum mengungkap pergeseran dalam komposisi nukleotida dan penggunaan kodon dalam genus Paramecium". BMC Genomics. 12: 272. doi:10.1186/1471-2164-12-272alt=Dapat diakses gratis. PMC 3118789alt=Dapat diakses gratis. PMID 21627782. 
  5. ^ Oborník, Miroslav; Lukeš, Julius (2015-10-15). "Genom Organellar dari Chromera dan Vitrella, Kerabat Fototrof Parasit Apikompleksa". Annual Review of Microbiology. 69: 129–144. doi:10.1146/annurev-micro-091014-104449. ISSN 0066-4227. PMID 26092225. Diakses tanggal 2024-04-15. 
  6. ^ Cornillot E, Hadj-Kaddour K, Dassouli A, Noel B, Ranwez V, Vacherie B, Augagneur Y, Brès V, Duclos A, Randazzo S, Carcy B, Debierre-Grockiego F, Delbecq S, Moubri-Ménage K, Shams-Eldin H, Usmani-Brown S, Bringaud F, Wincker P, Vivarès CP, Schwarz RT, Schetters TP, Krause PJ, Gorenflot A, Berry V, Barbe V, Ben Mamoun C (2012). "Sekuensing genom Apikompleksa terkecil dari patogen manusia Babesia microti". Nucleic Acids Res. 40 (18): 9102–14. doi:10.1093/nar/gks700. PMC 3467087alt=Dapat diakses gratis. PMID 22833609. 
  7. ^ Namasivayam, Sivaranjani; Baptista, Rodrigo P.; Xiao, Wenyuan; Hall, Erica M.; Doggett, Joseph S.; Troell, Karin; Kissinger, Jessica C. (Mei 2021). "Genom mitokondria terfragmentasi baru dalam patogen protista Toxoplasma gondii dan koksidia jaringan terkait". Genome Research. 31 (5): 852–865. doi:10.1101/gr.266403.120. PMC 8092004alt=Dapat diakses gratis Periksa nilai |pmc= (bantuan). PMID 33906963 Periksa nilai |pmid= (bantuan). 
  8. ^ Namasivayam, Sivaranjani; Sun, Cheng; Bah, Assiatu B.; Oberstaller, Jenna; Pierre-Louis, Edwin; Etheridge, Ronald Drew; Feschotte, Cedric; Pritham, Ellen J.; Kissinger, Jessica C. (7 November 2023). "Invasi besar-besaran DNA organellar mendorong evolusi genom nukleus di Toxoplasma". Proceedings of the National Academy of Sciences. 120 (45): –2308569120. Bibcode:2023PNAS..12008569N. doi:10.1073/pnas.2308569120. PMC 10636329alt=Dapat diakses gratis Periksa nilai |pmc= (bantuan). PMID 37917792 Periksa nilai |pmid= (bantuan). 
  9. ^ Gajadhar, A. A.; et al. (1991). "Urutan RNA ribosomal dari Sarcocystis muris, Theilera annulata, dan Crypthecodinium cohnii mengungkap hubungan evolusioner di antara apikompleksa, dinoflagellata, dan silia". Parasitologi Molekuler dan Biokimia. 45 (1): 147–153. doi:10.1016/0166-6851(91)90036-6. PMID 1904987. .
  10. ^ Cavalier-Smith, T. (1991). "Diversifikasi sel dalam flagelat heterotrof". Dalam Patterson, David J.; Larsen, Jacob; Systematics Association. Biologi flagelat heterotrof bebas. Oxford University Press. hlm. 113–131. ISBN 978-0-19-857747-8. 
  11. ^ Kumar, S. & Rzhetsky, A. 1996. Hubungan evolusioner kerajaan eukariotik. Jurnal Evolusi Molekuler, 42: 183–193

Pranala luar